| SIM output with parameters: | |
| M = 1, I = -1, V = -1 | |
| O = 6, E = 0.2 | |
| Upper Sequence : tob.38-44 | |
| Length : 6000 | |
| Lower Sequence : liv.42-48 | |
| Length : 6000 | |
| ********************************************************* | |
| Number 1 Local Alignment | |
| Similarity Score : 3265.4 | |
| Match Percentage : 76% | |
| Number of Matches : 4411 | |
| Number of Mismatches : 950 | |
| Total Length of Gaps : 378 | |
| Begins at (2, 6) and Ends at (5711, 5395) | |
| 0 . : . : . : . : . : | |
| 2 TATATATCATATATGTGGGTACATATTGTGTATCAAGAACAAAAAAATGC | |
| ||||||| ||||| ||-------------------| ||: | | |:|| | |
| 6 TATATATAATATAAGT ATAATTTATATACGC | |
| 50 . : . : . : . : . : | |
| 52 GGATATGGTCGAATGGTAAAATTTCTCTTTGCCAAGGAGAAGATGCGGGT | |
| ||:|||:||: ||||||||||||:|||:||||||||||||| |||||||| | |
| 37 GGGTATAGTTTAATGGTAAAATTCCTCCTTGCCAAGGAGAATATGCGGGT | |
| 100 . : . : . : . : . : | |
| 102 TCGATTCCCGCTATCCGCCCAAGATCCAAGATAAAGTAATTTTATTACTA | |
| |||||||||||||:|||||------------------------------- | |
| 87 TCGATTCCCGCTACCCGCC | |
| 150 . : . : . : . : . : | |
| 152 TTTATTTATTATTTAATTTCATAAATAGCATTAAATATATCCTTAAATTA | |
| -----------------------||| | | ||| || ---|||||| | | |
| 106 AATTGAAATAATTAG CTTAAAAAA | |
| 200 . : . : . : . : . : | |
| 202 AGGATTTGGTATAGTTGGCCGTGATAGTGTAGTGATTCTATCCCTCCCCT | |
| ||:|---------------------------------------------- | |
| 130 AGAA | |
| 250 . : . : . : . : . : | |
| 252 ACGTTTTCTTTTTCCTTCCACCCCCAAAAAGCGAAAGGCGGGAATTAATT | |
| ----------------------------------------------||| | |
| 134 AATA | |
| 300 . : . : . : . : . : | |
| 302 ACTAGTTAACAGAGTCAACCCTAAAATAGTTTGGCAAAACAAGATGTTGC | |
| | ||------------------|||||| ||| ----------| | || | |
| 138 AGTA AAAATATTTTTT TTTGGC | |
| 350 . : . : . : . : . : | |
| 352 GGAGACAGGATTTGAACCCGTGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA | |
| ||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||| | |
| 160 GGAGACAGGATTTGAACCTATGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA | |
| 400 . : . : . : . : . : | |
| 402 CCAAACTGCTCTACCCCGCGCCGAAGATAAGAACTGAAAACTAATAGATA | |
| |||:||||||||||:|||||::: |: ||| :| :||: || | ||| | |
| 210 CCAGACTGCTCTACTCCGCGTTATAATTAACGAAAAAAGTATACTCTATA | |
| 450 . : . : . : . : . : | |
| 452 AACAAGGATTAAATGCGCCCCTCCACCCTATCTGTACAAA TAG | |
| || | ||| | ||----------------------||||:-------| | | |
| 260 AAAATGGAATTAA ACAAGATATTTTTTG | |
| 500 . : . : . : . : . : | |
| 495 AATAGCCCATTTATACAGAATGGTAAAGGGGCTTCTATGATCATCGACCA | |
| ||||:|||-----------------------| :|| | || | |:| : | |
| 288 AATAACCC CGCCTCTTATAAGAGGCGG | |
| 550 . : . : . : . : . : | |
| 545 TAGAAATAGAAATGAAGCGTTAATCCTTACCAACTTGATCTTGTTGCTCC | |
| --------|||| :|| | ||| :||||||||| |||:| |||:|||| | |
| 315 GAAAGAAACCCAAAATGTTTACCAACTAGATTTGGTTACTCC | |
| 600 . : . : . : . : . : | |
| 595 TGGCAACAAACATGCATGAACCATTTCACGAAGTATGTGTCCGGATAGTC | |
| |||||:||||||||||||:||||||||||||||| :||||::||||: | | |
| 357 AGGCAATAAACATGCATGAGCCATTTCACGAAGTAAATGTCTAGATAAAC | |
| 650 . : . : . : . : . : | |
| 645 CAAAGTCTCGATAGTTAGCTCTCGGCCTTCCGGTCAAAAAACAACGTCGA | |
| ||||:|| |||||:|| |||:| ||:|||||:|||||||||||||| ||| | |
| 407 CAAAATCGCGATAATTTGCTTTAGGTCTTCCAGTCAAAAAACAACGACGA | |
| 700 . : . : . : . : . : | |
| 695 TGAAGGCGTGTAGGTGCACTATTCCGTGGTGGGGATTGTAACTTTCCATA | |
| |||||:|| || || |||||||| ||||||:::||||||||:|||:: |: | |
| 457 TGAAGACGAGTCGGGGCACTATTACGTGGTAAAGATTGTAATTTTTTTTG | |
| 750 . : . : . : . : . : | |
| 745 AATTTCCCATTTGTCACTCAACGACGGAACCTTGCTTATTTCTTTCTTTG | |
| || ||||||||| |||:::||:||:|:::::|: | ||||:|||:|||: | |
| 507 AAATTCCCATTTTTCATCTAATGATGAGGTTTCCGTAATTTTTTTTTTTA | |
| 800 . : . : . : . : . : | |
| 795 AGGATCGACGAATCGAATGATATTTCTGTTCCAATTTTTGCCTCTTCTTC | |
| |:|| : ||| | : | :|||||:| |||:|| |||||:||:||:||: | |
| 557 AAGAATTACGTAAAATTTTGTATTTTTTTTCTAAATTTTGTCTTTTTTTT | |
| 850 . : . : . : . : . : | |
| 845 TCCCTCTGAATCAAACTTTTCCTTGCCATAATGGTTGAATTCCTA | |
| ||:||:||||| |:|||:||::|||||||||| :|| |||| ||----- | |
| 607 TCTCTTTGAATAAGACTCTTTTTTGCCATAATTATTTAATTAGTAAGATA | |
| 900 . : . : . : . : . : | |
| 890 TTAGTATCCATGATACAAGTCGAATCCTAGATGTAGAAA | |
| -----------| |:| |::|| | | || : ||:| |:|||| | |
| 657 TTCTTTTTCAATAAATTTTTATTAAAAAATATTTTGAGTAAAATTGGAAA | |
| 950 . : . : . : . : . : | |
| 929 TAGAAGAAGGTGGACCCCCTCTCCGTCGAAAGAAATGAGATTATCGCAGA | |
| | ||--------------------------------------------- | |
| 707 TTTAA | |
| 1000 . : . : . : . : . : | |
| 979 TACACACATTAAAAATAT TAACCAAATTTGCCCGACGTAGAGGCAA | |
| ---------|| ||||||----|||||||||||:|| ||:|||||:|||| | |
| 712 TACAAATATAATTTAACCAAATTTACCAGATGTAGAAGCAA | |
| 1050 . : . : . : . : . : | |
| 1025 TCAAGAAAGCCGCATAAGTGAATATATAACCTACAGAAAAGTGAGCTAAT | |
| |:||:||||| ||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||| | |
| 753 TTAAAAAAGCAGCATAAGTAAATATATAACCTACAGAAAAATGAGCTAAT | |
| 1100 . : . : . : . : . : | |
| 1075 CCAACCAATCTTGCTTGTACAATGGAAAGGGCCACTGGTTTATCTCTCCA | |
| |||||:||||||||||| |||||:|||||:||:||||||||||||:|||| | |
| 803 CCAACTAATCTTGCTTGAACAATAGAAAGAGCTACTGGTTTATCTTTCCA | |
| 1150 . : . : . : . : . : | |
| 1125 GCGAATCAAATTGGCCAAAGGTGTGCGTTCATGAGCCCATGCTAAAGTTT | |
| |||||::||||| ||:||||| ||:|||||:|||||||| |||||||||| | |
| 853 GCGAACTAAATTCGCTAAAGGAGTACGTTCGTGAGCCCAAGCTAAAGTTT | |
| 1200 . : . : . : . : . : | |
| 1175 CAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGAAATTAAGAACATAAATCCA | |
| |||| |:|||:||||||||||||||||| || ||:|::|||||||||||| | |
| 903 CAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCA | |
| 1250 . : . : . : . : . : | |
| 1225 GTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACATCCATGCCCAAACCGATAA | |
| ||||||||||| |:||| ||||||||:||||||||||||||||| ||:|: | |
| 953 GTAGCCCAAACTAAATGACCAAATAAAAACATCCATGCCCAAACAGACAG | |
| 1300 . : . : . : . : . : | |
| 1275 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTGATAAGTTGTGAAGAGTTTA | |
| |||||||||||||||||||||||||||:||:|| |:|||||||||:|||| | |
| 1003 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCATTAATCAATTGTGAAGAATTTA | |
| 1350 . : . : . : . : . : | |
| 1325 ACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAAATAAGTGGAAGATTCATTA | |
| |||||||||||||:||||||||||||||:||||| ||:|||||||||||| | |
| 1053 ACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCATTAAATATGTAGAAGATTCATTA | |
| 1400 . : . : . : . : . : | |
| 1375 AACTGTGAAACGTTACCCTGCCATAATGTGATGTGCTTCCAATGCCAATA | |
| ||:|||| :|:|| ||:|||||||||||:||:||:|||||||||||||| | |
| 1103 AATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAATGTAATATGTTTCCAATGCCAATA | |
| 1450 . : . : . : . : . : | |
| 1425 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCAAATAAA | |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||| | |
| 1153 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCTAAATAAA | |
| 1500 . : . : . : . : . : | |
| 1475 ACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGGCCATCG | |
| | ||:||||| || |||||||||||||||||:|||||||| ||:|||||: | |
| 1203 AAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTCCAGGACCATCA | |
| 1550 . : . : . : . : . : | |
| 1525 CACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTTGGAACC | |
| || ||||||||||||||:|| ||:|||||||||||||||||:||:|| || | |
| 1253 CAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATTAATTTAGATCC | |
| 1600 . : . : . : . : . : | |
| 1575 ACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAAAC | |
| ||||||||||||||||||||:|||||:||:|||||||| |||||||||| | |
| 1303 TCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGTAGTATGTAAAC | |
| 1650 . : . : . : . : . : | |
| 1625 CAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATTGTTAAA | |
| | |:|||||||||:||||| ||:||||||||||||||||| ||||||||: | |
| 1353 CTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGACCAATTGTTAAG | |
| 1700 . : . : . : . : . : | |
| 1675 AATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGGCAACCA | |
| || |:|||||||||||| |:||| |:|||||:||||||||| ||:||||| | |
| 1403 AAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAACCAGGTAACCA | |
| 1750 . : . : . : . : . : | |
| 1725 GATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATAAAAGTA | |
| ||||||:|||| |||||:|||||||||::|:|:||||| |||||||||| | |
| 1453 TATGCTTTGACCAGCATTAAATGCTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTA | |
| 1800 . : . : . : . : . : | |
| 1775 CATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCATTGAGCA | |
| ||||:|| ||||||:|||:||||||||||||:|||||||||||||||||| | |
| 1503 CATCAAAACCATATAAAGCTTTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCA | |
| 1850 . : . : . : . : . : | |
| 1825 AATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCGGAGTGCCAAAGGCAAGCAT | |
| || |||||||||||:||:|||||:||:|| |||||:|||||:|||||||| | |
| 1553 AAAATAGGTTCAATTAAAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCAT | |
| 1900 . : . : . : . : . : | |
| 1875 GACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGGTATGGAATCCCAGAAAGAGGC | |
| :||||||||||||||:||||| ||:|::|||||:|||||:||||| |::| | |
| 1603 AACATCATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAAC | |
| 1950 . : . : . : . : . : | |
| 1925 TGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCTTCTTTATGCTCTAACATTCTT | |
| |:||||||||||||||:||||| ||||||||||||||:||||||||||| | |
| 1653 TAGCCCAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTA | |
| 2000 . : . : . : . : . : | |
| 1975 GCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGGATTGTAATCTCTAATGAAAAA | |
| ||:|||||||||||||:||||||:||||||||:|||||||||||:||:|| | |
| 1703 GCTAATACATTATCTTTATTTTGTTCCGGATTATAATCTCTAATAAAGAA | |
| 2050 . : . : . : . : . : | |
| 2025 TATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCATGATGAATCCTGCGATATATT | |
| |||||||||||||||||||| ||||||||:||:|| || ||:||||||| | |
| 1753 AATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATATATT | |
| 2100 . : . : . : . : . : | |
| 2075 GGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTAGTAAAGTCTTGTGCTATGAAT | |
| |:||:||:||||||||||||||||| || |||||:|||||||| | :||: | |
| 1803 GATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGAAAC | |
| 2150 . : . : . : . : . : | |
| 2125 GCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTGAGCTACCAAAGAAGTAATAAC | |
| |||||:| |||||||||:|||||:|||||||||||:||:||:|||||||| | |
| 1853 GCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAATAAC | |
| 2200 . : . : . : . : . : | |
| 2175 CCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATTGAAAATGAAGCGAATTATTGA | |
| :||||| || ||||:||||||:||||||||||||||||| |||||:||:| | |
| 1903 TCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGTTAA | |
| 2250 . : . : . : . : . : | |
| 2225 TTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGCCCCAATCGTCCCCCGGGGGGA | |
| | ||:|||||||||||:|||||||| || ||:|| |||||:|| ||:||| | |
| 1953 TAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGAGGA | |
| 2300 . : . : . : . : . : | |
| 2275 ATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCATACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGT | |
| :|||| |: || |:|| ||||| |||||:|| |||||:||:|||||:|| | |
| 2003 GTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATTAGT | |
| 2350 . : . : . : . : . : | |
| 2325 TCTATACATATGACCAGCAACGAGAAAAATAAATGCAATAGCTAAATGGT | |
| |||||||||||||||||| |::| |||||:|| |||||||||||||||:| | |
| 2053 TCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAATGAT | |
| 2400 . : . : . : . : . : | |
| 2375 GATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAACTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCC | |
| |:||:||||||||||| ||||||||||||||:|||||||||||:||||| | |
| 2103 GGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAATCCA | |
| 2450 . : . : . : . : . : | |
| 2425 CCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCCCGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAA | |
| ||:| ||:|||||::||:|| ||||| ||||||||:| || ||||| : | |
| 2153 CCAATAAAAGTTAAGATAGCTGTTCCAGCCCCTTGAGATGTTCCAAAAGC | |
| 2500 . : . : . : . : . : | |
| 2475 ATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAGCATAAAGATTCCATTGACCTGTAA | |
| ||||:|||||||||||: :||||||||:|||| ||||||||| ||||:|| | |
| 2203 ATGATTACTTGAATCGACATTTTGAGCGTAAATATTCCATTGTCCTGCAA | |
| 2550 . : . : . : . : . : | |
| 2525 AAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGATGCGGTAATACATCTAAGAAATTATTC | |
| |||:|||:||||::|||| |||||:|||||| : :|||:|||||||:| | |
| 2253 AAAATGGACCTAGTCCTTCCGGATGTGGTAATTTTGTTAAAAAATTATCC | |
| 2600 . : . : . : . : . : | |
| 2575 CACCGAACGTACTCCCCTCTGGATGCAGGAATAGCAACATGAACTAAATG | |
| ||:| ||||::|| ||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| | |
| 2303 CATCTTACGTGTTCGCCTCTTGATTCTGGAATTGCCACATGAACTAAATG | |
| 2650 . : . : . : . : . : | |
| 2625 CCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCAAAGAGTCCTGACAAATGATGAT | |
| |||||||||||:|| ||:|||||:|||||:||||||||:|||||||||| | |
| 2353 ACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCCTGATAAATGATGAT | |
| 2700 . : . : . : . : . : | |
| 2675 TCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCAGGAAACGCTCGGTTTCCATTTC | |
| |:|:|||||||||:||||||||:|||||||| || :| ||||||||||| | |
| 2403 TTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTTTAGGTTTCCATTTA | |
| 2750 . : . : . : . : . : | |
| 2725 GGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTAAGGATATGGCAGAAAGAAATAA | |
| |||||||::||||||||||||||||||||||| ||:| ||||||| | | |
| 2453 GGTTGTAAATGTAACCAACCTGCTATTAAGGAAATAGACGAAAGAATAAC | |
| 2800 . : . : . : . : . : | |
| 2775 TAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCTTCATTAGTGCGTAAACCGATTG | |
| ||:||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||:|||| | |
| 2503 TAAAAAAAGAGCTCCATTATAAAGATCTTGATTAGTTCGTAAACCAATTG | |
| 2850 . : . : . : . : . : | |
| 2825 TATACCACCACTGATAAACACCAGAATAAGCGATATTCACTGGGCCAAGA | |
| ||||||||||:||:|| ||||||||||| || ||||| ||||| |||::| | |
| 2553 TATACCACCATTGGTATACACCAGAATATGCTATATTAACTGGTCCAGAA | |
| 2900 . : . : . : . : . : | |
| 2875 GCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGGCCGGTTGACCAAAATGAGGATC | |
| || ||:||||||||||||||||| ||:||:|||||||||||||| ||||| | |
| 2603 GCTCCTCCTCGAGTAAAAGCTTCAACAGCTGGTTGACCAAAATGCGGATC | |
| 2950 . : . : . : . : . : | |
| 2925 CCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACATGTAAAGGGTCCTGTACCCACG | |
| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||:||| ||||:| | |
| 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG | |
| 3000 . : . : . : . : . : | |
| 2975 ACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCAC | |
| :|||||||| ||||||||||| ||:|||||:|:||| ||:||||||||: | |
| 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT | |
| 3050 . : . : . : . : . : | |
| 3025 AGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGTGAGAAGCAAAAATATTCTGATA | |
| |:|||||| |||||||||||||||||:|| || |||||||| ||:||||| | |
| 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGATA | |
| 3100 . : . : . : . : . : | |
| 3075 AAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGACTCTCGAAGTCATGTGCGGTAG | |
| |||||||||:||||| ||||||||||||||:||:|||||||||||||| | | |
| 2803 AAGACGTTCTTCAGTCATATCATCATGACTTTCAAAGTCATGTGCGGTCG | |
| 3150 . : . : . : . : . : | |
| 3125 CAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGTGGGGTCCTGAGCTAAGCCTTGG | |
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||:|||| ||:|||:||| | |
| 2853 CAATACCAAACCAAATACGACGCGTAGTTGGGTCTTGAGATAGGCCCTGG | |
| 3200 . : . : . : . : . : | |
| 3175 CTAAACCTTGGAAATCGTAATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCT AGC | |
| |||||::| ||||||| |:|||||||||||||||||||||||||||-||| | |
| 2903 CTAAATTTGGGAAATCTTGATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCTTAGC | |
| 3250 . : . : . : . : . : | |
| 3224 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAAGAAGAATGCCCATGTTGTGGC | |
| ||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||| | |
| 2953 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAGAAAGAATGCCCATGTTGTGGC | |
| 3300 . : . : . : . : . : | |
| 3274 AATTCCACCCAGAAGGTAATGGGTTACTCCTACAGCACGTCCTTGTATAA | |
| |||||||||:|||||||||||:|:||||||||||||||| ||||||:||| | |
| 3003 AATTCCACCTAGAAGGTAATGAGCTACTCCTACAGCACGGCCTTGTGTAA | |
| 3350 . : . : . : . : . : | |
| 3324 TGCTCAAGGCTCTCGGCTGAGTAGCAGGAGCAACTTTTAATTTATTATGA | |
| |:||:||||| | |||||::||||||||||||||||||||||:||:||| | |
| 3053 TACTTAAGGCGCGAGGCTGGATAGCAGGAGCAACTTTTAATTTGTTGTGA | |
| 3400 . : . : . : . : . : | |
| 3374 GCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACTGAA | |
| ||||||||:||||||||||||||:||||||||||| ||||| |||||:|| | |
| 3103 GCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACTAAA | |
| 3450 . : . : . : . : . : | |
| 3424 TAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAA | |
| ||::||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||::|| |||| | |
| 3153 TAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATAAAA | |
| 3500 . : . : . : . : . : | |
| 3474 GGCCATATGCAGATAATGAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGGGATGCC | |
| |:||||| |||||||| ||||||||||||||:||||||||:||:|| ||: | |
| 3203 GACCATAAGCAGATAAGGAAGAACCATAAGATTGAATTACTTGAGAAGCT | |
| 3550 . : . : . : . : . : | |
| 3524 TGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCATTAATAGTAATAGAACTTTG | |
| |||||||||||:||:||:||:||||| |||||||||||||||| :||||| | |
| 3253 TGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAATAGTAATAGCGCTTTG | |
| 3600 . : . : . : . : . : | |
| 3574 CGCAAAGTTTCCTCCCGTGATATGAGTTACTACCCCTTGATCACTTACAC | |
| :|||||:||||| || ||:||||||||||| || ||||| ||:||||:| | |
| 3303 TGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACACCTTGCTCGCTTATAG | |
| 3650 . : . : . : . : . : | |
| 3624 TGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACTACC | |
| |:||||||||||| ||:||||||||||||||:||:||:|| || ||||| | |
| 3353 TACCCCAAACATCAGATTGCATTTTCCAACTAAAGTGAAAAATAACTACA | |
| 3700 . : . : . : . : . : | |
| 3674 GAAATTGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAGGC | |
| ||||| | |||:||||||||:||||: ||||||||:||||||||||| || | |
| 3403 GAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTAAGAAAACATGATCCCATGC | |
| 3750 . : . : . : . : . : | |
| 3724 CGATACTTGACATGTACCCCCTCTTCCAGGTCCATCACAAGGAAAACGAA | |
| ||||||||||| || ||:|||||||||||||||||:||||||||||||| | |
| 3453 AGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGTCCATCGCAAGGAAAACGAA | |
| 3800 . : . : . : . : . : | |
| 3774 AACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTCAAACGGGAACTGCGAGCAAATAGA | |
| |||||||:|| |||||:||:|||:|||||||:||||| ||||||||||:| | |
| 3503 AACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACGAGAACTTCGAGCAAATAAA | |
| 3850 . : . : . : . : . : | |
| 3824 ACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGTCACATGAATCGTAAATGCATGAAT | |
| ||||||||:|| |: ||:|: :| ||:||||||||:|||||||||||||| | |
| 3553 ACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACATGAATTGTAAATGCATGAAT | |
| 3900 . : . : . : . : . : | |
| 3874 GTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTCCTAATGGAATAGGCAACAAAGCCA | |
| :||||||||:||:|||||:|| ||||||||:||||| ||:||:||||| | | |
| 3603 ATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAACGGAATTGGTAATAAAGCAA | |
| 3950 . : . : . : . : . : | |
| 3924 CCTTGCCACCCACTGCCACTAAATCACCACCCCCCCAAGTTAAACTGGTA | |
| |:||:|:||| |||||:|:|| :|| ||||| ||||| ||||||||:||| | |
| 3653 CTTTACTACCAACTGCTATTACGTCTCCACCACCCCATGTTAAACTAGTA | |
| 4000 . : . : . : . : . : | |
| 3974 CTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGTGCTAAAGCATGGGTGTT | |
| ||||||: |||::|||||| || : ::: |||||||||||||| ||||| | |
| 3703 CTTGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAAAGTTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTT | |
| 4050 . : . : . : . : . : | |
| 4024 TTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTATAGCGGTATCTGAAA | |
| |||||||||||||||||||||:||||||||||| |||||:|||||||||| | |
| 3753 TTGTATCCATTGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAA | |
| 4100 . : . : . : . : . : | |
| 4074 ACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTATCATTATGAATATAC | |
| ||||||||||||||||:||||||||:||||| |||||||||||||||||: | |
| 3803 ACATATCTTGAGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATAT | |
| 4150 . : . : . : . : . : | |
| 4124 AAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCCCAGTTGAGATGGGA | |
| || ||||||||:||||| ||||:||| ||:|||:||||:||:||||| || | |
| 3853 AATCCAAAACTATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGA | |
| 4200 . : . : . : . : . : | |
| 4174 TATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAATAGATCGTTGTACC | |
| ||| |||||||||||||||| |||:|| ||||||||:|:||:||||||:: | |
| 3903 TATTATTGCATCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATT | |
| 4250 . : . : . : . : . : | |
| 4224 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCGGCA | |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|| |||||:||:||| | |
| 3953 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCA | |
| 4300 . : . : . : . : . : | |
| 4274 GCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAATGA | |
| ||||||||||| |:||||||||||||||||||:||||||||:|| |: || | |
| 4003 GCACCAACTATTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGA | |
| 4350 . : . : . : . : . : | |
| 4324 CAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGATACGGATAAGGGGGCATGGAAT | |
| ||||| |||||:||:||||||||||:|||:||||||||:|||||:| :| | |
| 4053 AAGTTGAGTACCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGT | |
| 4400 . : . : . : . : . : | |
| 4374 ACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAAGTTA | |
| |||||||:||||||||||:|||:||||||||:||:|||||||||||:||| | |
| 4103 ACATATGATGAGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTA | |
| 4450 . : . : . : . : . : | |
| 4424 AGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTGTTAGGATCTCATATAGGCCTTT | |
| || | |||||||||||||||||| |||||||::||:||||| ||:||||| | |
| 4153 AGTGCTAATTGAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTT | |
| 4500 . : . : . : . : . : | |
| 4474 ATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCTTTTA | |
| |||:|||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |
| 4203 ATGACCCTCTCCAGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAA | |
| 4550 . : . : . : . : . : | |
| 4524 GTCCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGG | |
| : |:||||||:|||||||||||:|| | ||||||:|||||:||||::|:: | |
| 4253 AACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAA | |
| 4600 . : . : . : . : . : | |
| 4574 AAAAGAATTGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAG | |
| |||||||:|||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:|||:|: | |
| 4303 AAAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAA | |
| 4650 . : . : . : . : . : | |
| 4624 ACCCCCAGTTACTGGATCTAATCCTCCACGAAAAGTAAGAAAGTCCGCAT | |
| ||| |||||||||||||: |:||||||||||||||| |:|||||| | || | |
| 4353 ACCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAGAAT | |
| 4700 . : . : . : . : . : | |
| 4674 ATTTTGACCAATTCAAGGTGAAAAATGGGGTTGCTCCCTCGGCAAAACTG | |
| |||:|||||||||:||:||:||||| ||:|||: :||:|: ||||||||: | |
| 4403 ATTCTGACCAATTTAAAGTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAACTA | |
| 4750 . : . : . : . : . : | |
| 4724 GGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCTCGATTCAAGATAAATTCATGAGGAAG | |
| ||:||||||| |||:|||||||| |||||:||:||||||||||||||||| | |
| 4453 GGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGGAAG | |
| 4800 . : . : . : . : . : | |
| 4774 TGGTATCTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAATTGGTTAATCGGTA | |
| |||||:||||| ||||| ||||||||:|:||:||::||:||||| |||| | |
| 4503 AGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAGGTA | |
| 4850 . : . : . : . : . : | |
| 4824 AAGATACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGT | |
| |||| ||||||||||||||:|| ||||||||:||||| || |: ||||: | |
| 4553 AAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCTAAA | |
| 4900 . : . : . : . : . : | |
| 4874 AGCCCTGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGC | |
| || |||||:|||||:|||||:||||||||||| ||||||||||||||||| | |
| 4603 AGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCAAGC | |
| 4950 . : . : . : . : . : | |
| 4924 CAATTTTGGCGCCGCTTTATGATAATGAAACCAACCAGCAAAAAGCATTA | |
| :|||||||| || |||||:|||||||||||||| || ||||||||||||| | |
| 4653 TAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAATGAAACCATCCTGCAAAAAGCATTA | |
| 5000 . : . : . : . : . : | |
| 4974 ACGCTGCAAAGACCAATGCCCCAATTGCTGTACAATAGAGTTGTAATTCA | |
| |:||||||||:||:||| | |||||||| ||| ||||:|||||||||||| | |
| 4703 ATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGTAATTCA | |
| 5050 . : . : . : . : . : | |
| 5024 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAATCTGAAAAAAACCAGAGGTTATTTG | |
| ||||||||||||||||||||||||| :||||||||:||:||||||||||| | |
| 4753 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGAGGTTATTTG | |
| 5100 . : . : . : . : . : | |
| 5074 TATTCCTCGGAAACCCCCGCCTACGTCACCATTTAATATTTCTTGGCCCA | |
| |||||||:|:||||||||||| ||:|| |||||||| ||||||||:|| | | |
| 4803 TATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAATTTCTTGACCAA | |
| 5150 . : . : . : . : . : | |
| 5124 CTATTGGCCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTT | |
| |||| |||||||| ||:||:|||||:|||::|||:||||| ||||||||| | |
| 4853 CTATAGGCCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATATGAGTAGGATCACTT | |
| 5200 . : . : . : . : . : | |
| 5174 AGCCACGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCT | |
| |:|||:||||||||||||||||||||||||||:||:||:|||||:||:|| | |
| 4903 AACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATGAAAGTACATACCACT | |
| 5250 . : . : . : . : . : | |
| 5224 CAGCCAAAGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTT | |
| :|:||||| |||:||||||| |:||| ||:||||| |||||||| ||:| | |
| 4953 TAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAATGAGCACTAAAAACCT | |
| 5300 . : . : . : . : . : | |
| 5274 TTCGAGAGATCTCCTCCAAATCACTGGTATGGCTATCGAAATCGTGAGCA | |
| | |||||:||:||:||:||||||:||||||||||:||:|||||:|||||| | |
| 5003 TACGAGAAATTTCTTCTAAATCATTGGTATGGCTGTCAAAATCATGAGCA | |
| 5350 . : . : . : . : . : | |
| 5324 TCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTGGTAGTATCAGGCCCTTTAGCTAT | |
| ||||||||||::|||||:|||||||||||||||::||| ||:||||||| | |
| 5053 TCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGTACTAGGACCCTTAGCTAG | |
| 5400 . : . : . : . : . : | |
| 5374 TGTTCTTGAGAAATGACCCGGTCTGGCCCATTCCTCGAACGAAGTTTTTA | |
| ||:|||||:||||| || |||:|:|||||||::||:|| ||:||||||| | |
| 5103 AGTCCTTGAAAAATGCCCAGGTTTAGCCCATTTTTCAAAAGAGGTTTTTA | |
| 5450 . : . : . : . : . : | |
| 5424 CGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTAACTTCTGGTTCCGGCGAACGAATA | |
| |:||||||:| ||:|||| |||:||:||||||||||||||:||||||||| | |
| 5153 CAGGATCCTTTTCCACCACAATCTTGACTTCTGGTTCCGGTGAACGAATA | |
| 5500 . : . : . : . : . : | |
| 5474 ATCATTGAG TCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAGACCCGCCA | |
| :||||:|||-|:|||||||:|:|:|||:| :|||| :||-|:|||::||| | |
| 5203 GTCATCGAGGTTCTCCTCTCTTCAGACGAGGCATAGGAA AAACCTACCA | |
| 5550 . : . : . : . : . : | |
| 5523 ACAGTCAAATAATTAGTGAACCTTAGAGATAGAGAGATATTTCTATAATT | |
| |||-----|||||||||:|||:|: |||| | | |||| || |---- | |
| 5252 ACA ATAATTAGTAAACTTCTGAGAGATCCATATATAACTTT | |
| 5600 . : . : . : . : . : | |
| 5573 AGTTCGTTTCTCTTCTATTTTTCTATCTCCCATCTATCTATTTTCTTTAG | |
| ---------------|| |:||| ||||-------------------|| | |
| 5293 TAGATCTCTTTCTC AG | |
| 5650 . : . : . : . : . : | |
| 5623 TTATTTACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGATCCGGGGCAAGTGTTC | |
| || |||:||:|||:||| || ::|||:|::--|| :||||:|| ||| | |
| 5309 TTTAAAACTGGAACAACTATTATACAGAAATTA CCTAGGCAGGTCTTC | |
| 5700 . : . : . : . | |
| 5673 GGATCTATTATGACATAGCCTTGAGGCGCTCAACGGACC | |
| ::||:||||||||||:|:::||:|||:|||:||:||||| | |
| 5357 AAATTTATTATGACACAATTTTAAGGTGCTTAATGGACC | |
| ********************************************************* | |
| Number 2 Local Alignment | |
| Similarity Score : 278.4 | |
| Match Percentage : 55% | |
| Number of Matches : 1171 | |
| Number of Mismatches : 711 | |
| Total Length of Gaps : 218 | |
| Begins at (1156, 3100) and Ends at (3152, 5084) | |
| 0 . : . : . : . : . : | |
| 1156 TGAGCCCATGCTAAAGTTTCAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGA | |
| |||||||| :| | :| |||||| |::||:|||||||||||||| | | | |
| 3100 TGAGCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACT | |
| 50 . : . : . : . : . : | |
| 1206 AATTAAGAACATAAATCCAGTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACA | |
| || ||||||||| || |:|: |||||||||||::|| || |||:||:| | |
| 3150 AAATAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATA | |
| 100 . : . : . : . : . : | |
| 1256 TCCATGCCCAAACCGATAAACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTG | |
| : | :||:| |||||: ------------|||:|::||| | : | |
| 3200 AAAGACCATAAGCAGATAAGG AAGAACCATAAGATTGA | |
| 150 . : . : . : . : . : | |
| 1306 ATAAGTTGTGAAGAGTTTAACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAA | |
| || | ||| |||| | |: ||||||| |:|| | |:|||:|| | | | |
| 3238 ATTACTTGAGAAGCTTGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAAT | |
| 200 . : . : . : . : . : | |
| 1356 ATAA GTGGAAGATT CATTAAACTGTGAAACGTTAC | |
| | |----------||| ||:|||-----|: ||| || | ||: :|| | |
| 3288 AGTAATAGCGCTTTGTGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACAC | |
| 250 . : . : . : . : . : | |
| 1391 CCTGC CATAATGTGATGTGCTTCCAATG | |
| |:|||----------------------|| | ||:: |----||||||: | |
| 3338 CTTGCTCGCTTATAGTACCCCAAACATCAGATTGCATT TTCCAACT | |
| 300 . : . : . : . : . : | |
| 1419 CCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCA | |
| |:|:||||:||||: ||||| ||| |||||||||| | |:| | |
| 3384 AAAGTGAAAAATAACTACAGAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTA | |
| 350 . : . : . : . : . : | |
| 1469 AATAAAACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGG | |
| |: ||| :|||||||| || |: | |||||| || |||| ||| || | |
| 3434 AGAAAACATGATCCCATGCAGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGT | |
| 400 . : . : . : . : . : | |
| 1519 CCATCGCACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTT | |
| |||||||| ||||||| | ||||:|:||: :|||:|||||:||:|| : | |
| 3484 CCATCGCAAGGAAAACGAAAACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACG | |
| 450 . : . : . : . : . : | |
| 1569 GGAACCACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTAT | |
| :||||: || ||| ||||:||||||||| |||:||:|| ::||||::|| | |
| 3534 AGAACTTCGAGCAAATAAAACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACAT | |
| 500 . : . : . : . : . : | |
| 1619 GTAAACCAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATT | |
| | | :||: ||| |::|||||| ||:|||||:||| | | |||| : | |
| 3584 GAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAAC | |
| 550 . : . : . : . : . : | |
| 1669 GTTAAAAATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGG | |
| | | ::||||:|| :| : || ::|::||| || |||--|: |:| : | |
| 3634 GGAATTGGTAATAAAGCAACTTTACTACCAACTGCTATTA CGTCTCCA | |
| 600 . : . : . : . : . : | |
| 1719 CAACCAGATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATA | |
| | ||| |||-|| :||: |:|:|---||||::| ||:| | | || | | |
| 3682 CCACCCCATG TTAAACTAGTACT TGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAA | |
| 650 . : . : . : . : . : | |
| 1769 AAAGTACATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCAT | |
| |:---------------| ||: |:| | |||| |:| |||||||||| | |
| 3728 AG TTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTTTTGTATCCAT | |
| 700 . : . : . : . : . : | |
| 1819 TGAGCAAATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCG | |
| |||||||| |:||||| | : ::|| | ||:|------------- | |
| 3763 TGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTG | |
| 750 . : . : . : . : . : | |
| 1856 GAGTGCCAAAGGCAAGCATGACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGG | |
| --|| || ||:||| ||| ::|||||||||||:||| |:||| |:: | |
| 3813 AGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATATAATCCAAAAC | |
| 800 . : . : . : . : . : | |
| 1904 TATGGAATCCCAGAAAGAGGCTGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCT | |
| ||||:|||||:|:||||| || :|||||:| |:||| ||||| || || | |
| 3863 TATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGATATTATTGCA | |
| 850 . : . : . : . : . : | |
| 1954 TCTTTATGCTCTAACATTCTTGCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGG | |
| || : |||:: |: |:|| |:||:| |||:|: | | ::|| | |
| 3913 TCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATTGAGTAGTTGG | |
| 900 . : . : . : . : . : | |
| 2004 ATTGTAATCTCTAATGAAAAATATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCA | |
| ||::|||||||| |: | ||| ||||| |||| |||: ||| || :::| | |
| 3963 ATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCAGCACCAACTA | |
| 950 . : . : . : . : . : | |
| 2054 TGATGAATCCTGCGATATATTGGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTA | |
| | | :||||| |:|| :|: :||:|| ||| | |: | |: ||||||| | |
| 4013 TTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGAAAGTTGAGTA | |
| 1000 . : . : . : . : . : | |
| 2104 GTAAAGTCTTGTGCTATGAATGCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTG | |
| :: |:|| |||| : ||| ||||| |||:| || ||||||:|| || | |
| 4063 CCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGTACATATGATG | |
| 1050 . : . : . : . : . : | |
| 2154 AGCTACCAAAGAAGTAATAACCCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATT | |
| |||||| | |: ||| | |: ||:|| : |||||:| :||| |||||| | |
| 4113 AGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTAAGTGCTAATT | |
| 1100 . : . : . : . : . : | |
| 2204 GAAAATGAAGCGAATTATTGATTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGC | |
| ||: ||| ::||| | | | :| |||||||||||:||||| || : : | |
| 4163 GAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTTATGACCCTCT | |
| 1150 . : . : . : . : . : | |
| 2254 CCC AATCGTCCCCCGGGGGGAATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCAT | |
| || ---||| | ||::---------|||| || ||||||| ||||| | | |
| 4213 CCAGTAAATGGACCTT TATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAAA | |
| 1200 . : . : . : . : . : | |
| 2301 ACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGTTCTATACATATGACCAGCAACGAGAA | |
| |||:|| ||:|| || |:||:|| | |||||||||||| || || |:|| | |
| 4254 ACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAAA | |
| 1250 . : . : . : . : . : | |
| 2351 AAATAAATGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAA | |
| ||| || |||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:||||||| | |
| 4304 AAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAAA | |
| 1300 . : . : . : . : . : | |
| 2401 CTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCCCCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCC | |
| |: : ||| ||||| :|:|||:||: |||:|||||:|| | |||---- | |
| 4354 CCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAG | |
| 1350 . : . : . : . : . : | |
| 2451 CGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAAATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAG | |
| ------------------|| ||||:| || || ------------ | |
| 4400 AATATTCTGACCAATTTAAA | |
| 1400 . : . : . : . : . : | |
| 2501 CATAAAGATTCCATTGACCTGTAAAAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGA | |
| --------------------|||||||: ||: :|||||||| | |--- | |
| 4420 GTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAA | |
| 1450 . : . : . : . : . : | |
| 2548 TGCGGTAA TACATCTAAGAAATTA | |
| -|: |||||--| || ||||:|:||:|----------------------- | |
| 4450 CTAGGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGG | |
| 1500 . : . : . : . : . : | |
| 2572 TTCCACCGAACGTACTCC CCTCTGGATGC AG | |
| ---------|||: ::|:|: |||||--| |||::| ||--------|| | |
| 4500 AAGAGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAG | |
| 1550 . : . : . : . : . : | |
| 2603 GAATAGCAACATGAACTAAATGCCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCA | |
| | | || |||||| ||| :|||:|| |:||||| |::||||:|| ||| | |
| 4550 GTAAAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCT | |
| 1600 . : . : . : . : . : | |
| 2653 AAGAGTCCTGACAAATGATGATTCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCA | |
| ||:|| |||| :|||||||||||:|| ||||||::|||:|| :||||| | |
| 4600 AAAAGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCA | |
| 1650 . : . : . : . : . : | |
| 2703 GGAAACGCTCGGTTTCCATTTCGGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTA | |
| :| | :|:|| : ||| | |: ---|| ||||| ||||| | | | |
| 4650 AGCTAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAA TGAAACCATCCTGCAAAAA | |
| 1700 . : . : . : . : . : | |
| 2753 AGGATATGGCAGAAAGAAATAATAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCT | |
| : : || || | ||:|| |||| | || ||| :|| |||||| | | | |
| 4697 GCATTAATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGT | |
| 1750 . : . : . : . : . : | |
| 2803 TCATTAGTGCGTAAACCGATTGTATACCACCACTGATAAACACCAGAATA | |
| |:| |: || ||:: ||: ::||| ::||| ||| :||:||--- | |
| 4747 AATTCACTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGA | |
| 1800 . : . : . : . : . : | |
| 2853 AGCGATATTCACTGGGCCAAGAGCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGG | |
| ---|:| |: |: || ||: |||||| | |::| | |::| :: | |
| 4794 GGTTATTTGTATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAA | |
| 1850 . : . : . : . : . : | |
| 2903 CCGGTTGACCAAAATGAGGATCCCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACA | |
| :: |||||||| |||---|||||: :| |||||| |:||::| |:| | |
| 4841 TTTCTTGACCAACTATAGG CCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATA | |
| 1900 . : . : . : . : . : | |
| 2953 TGTAAAGGGTCCTGTACCCACGACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATG | |
| || : |||:|| : || |||:| :||| |||| : |:||| |||| | |
| 4888 TGAGTAGGATCACTTAACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATG | |
| 1950 . : . : . : . : . : | |
| 3003 AAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGT | |
| ||| : | ||: : ||| | |||||| || |||||||| |||||:| | |
| 4938 AAAGTACATACCACTTAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAAT | |
| 2000 . : . : . : . : . : | |
| 3053 GAGAAGCAAAAATATTCTGATAAAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGA | |
| ||| | :|||||: || :|| ||| ---|||:|| : | :||:: :|||: | |
| 4988 GAGCACTAAAAACCTTACGAGAAAT TTCTTCTAAATCATTGGTATGG | |
| 2050 . : . : . : . : . : | |
| 3103 CTCTCGAAGTCATGTGCGGTAGCAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGT | |
| || ||:||:||||| ||: :|||| | |||||| |:| :||||| | |
| 5035 CTGTCAAAATCATGAGCATCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGT | |
| ********************************************************* | |
| Number 3 Local Alignment | |
| Similarity Score : 255.2 | |
| Match Percentage : 57% | |
| Number of Matches : 788 | |
| Number of Mismatches : 417 | |
| Total Length of Gaps : 159 | |
| Begins at (3371, 884) and Ends at (4659, 2163) | |
| 0 . : . : . : . : . : | |
| 3371 TGAGCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACT | |
| |||||||||:| | :| ||||||||||||||||||||| |||||:| | |
| 884 TGAGCCCAAGCTAAAGTTTCAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGA | |
| 50 . : . : . : . : . : | |
| 3421 GAATAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAA | |
| | :|||||||| || |:|: ||||||:|| |||||| || ||----|| | |
| 934 TATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAACTAAATGACCAAATA AA | |
| 100 . : . : . : . : . : | |
| 3471 AAAGGCCATATGCAGATAATGA AGAACCATAAGA | |
| || : ||||:: ||:|:|: |----------------||:|::||| | |
| 980 AACATCCATGCCCAAACAGACAGACTATTCATACCAAAAGGATTATATCC | |
| 150 . : . : . : . : . : | |
| 3505 CTGAATTACCTGGGATGCCTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCAT | |
| | |||:| :|| || | | |: ||||||: |||| | |:||| || | |
| 1030 ATTAATCAATTGTGAAGAATTTAACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCA | |
| 200 . : . : . : . : . : | |
| 3555 TAATAGTAATAGAACTTTGCGCAAAGTTTCCTCC CGTGATATGAG | |
| | | | :||||| || :||| | | || |-----| || :||:| | |
| 1080 TTAAATATGTAGAAGATTCATTAAATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAAT | |
| 250 . : . : . : . : . : | |
| 3600 TTACTACCCCTTGATCACTTACACTGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTC | |
| || ||: --------------------------------------|||| | |
| 1130 GTAATATG TTTC | |
| 300 . : . : . : . : . : | |
| 3650 CAACTGAAATGGAATATTACTACCGAAATTGCATTGTACATCCAGAATAG | |
| |||: |||::|| :| ||: : ||| |:||| |||||||:|| | | |
| 1142 CAATGCCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAAC | |
| 350 . : . : . : . : . : | |
| 3700 TCCTAAGAAGACATGATCCCAGGCCGATACTTGACATGTACCCCCTCTTC | |
| | ||||: |:| | ||||||:|| || |: | ||| ||||| |||| || | |
| 1192 TGCTAAATAAAAAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTC | |
| 400 . : . : . : . : . : | |
| 3750 CAGGTCCATCACAAGGAAAACGAAAACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTC | |
| |||| |||||||||||||||| | ||||||: |:| :||||||:||::|: | |
| 1242 CAGGACCATCACAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATT | |
| 450 . : . : . : . : . : | |
| 3800 AAACGGGAACTGCGAGCAAATAGAACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGT | |
| || : :|| |: || ||| ||:|:||||||||| |: ||:|:||: || | |
| 1292 AATTTAGATCCTCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGT | |
| 500 . : . : . : . : . : | |
| 3850 CACATGAATCGTAAATGCATGAATGTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTC | |
| ::||| | : || ||| |::|||||||||:||:||:||: |:| | | |
| 1342 AGTATGTAAACCTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGAC | |
| 550 . : . : . : . : . : | |
| 3900 CTAATG GAATAG GCAACAAAGCCA | |
| | | ||----||| ||----------------------||| | || | | | |
| 1392 CAATTGTTAAGAAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAA | |
| 600 . : . : . : . : . : | |
| 3924 CCTTGCCACCCACTGC CACTAAATCACCACCCCCCCAAGTT | |
| || |: ||| |||---------||:||||| ---------------- | |
| 1442 CCAGGTAACCATATGCTTTGACCAGCATTAAATG | |
| 650 . : . : . : . : . : | |
| 3965 AAACTGG TACTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGT GCT | |
| ---||||--||:|||:|| || |:| :| : : |||| :|---||| | |
| 1476 CTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTACATCAAAACCATATAAAGCT | |
| 700 . : . : . : . : . : | |
| 4010 AAAGCATGGGTGTTTTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTAT | |
| | ||||:|:: ||||||||||||||||||||::|||| | | ---- | |
| 1523 TTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCAAAAATAGGTTCAATTA | |
| 750 . : . : . : . : . : | |
| 4060 AGCGGTATCTGAAAACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTAT | |
| -----------||| : |:|| |||| || |||||: |||:::|| | |
| 1569 AAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCATAACAT | |
| 800 . : . : . : . : . : | |
| 4110 CATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCC | |
| |||||||||::|| |:||| ||| |:||||| |||||||||| || ||| | |
| 1608 CATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAACTAGCC | |
| 850 . : . : . : . : . : | |
| 4160 CAGTTGAGATGGGATATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAA | |
| ||::| |:||||||||| || || || : ||||:: |: |: | | |||| | |
| 1658 CAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTAGCTAA | |
| 900 . : . : . : . : . : | |
| 4210 TAGATCGT TGTACCGAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCAT | |
| || ||::|--------||| |||--------|||:||||||||| |: | | |
| 1708 TACATTATCTTTATTTTGTTCCG GATTATAATCTCTAATAAA | |
| 950 . : . : . : . : . : | |
| 4252 AAAAATGGCTGCATGCGCGGCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCC | |
| :|||||:||| |||| ||:: |||||| :::||:| ||| ||| |||| : | |
| 1750 GAAAATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATAT | |
| 1000 . : . : . : . : . : | |
| 4302 ACATGTGATGTGTGAACAATGACAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGA | |
| |: :||||| ||: |:|||| : |||:|| :| |:|| || ||| | |
| 1800 ATTGATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGA | |
| 1050 . : . : . : . : . : | |
| 4352 TACGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAA | |
| ||| |||:||:||:| :||||||||||| |||||||| | :: ||| | | |
| 1850 AACGCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAAT | |
| 1100 . : . : . : . : . : | |
| 4402 AGAGCCTAACATAGCTAAGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTG | |
| |: ||||||: |||||: :|||| |||||||: ||| : || | | |
| 1900 AACTCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGT | |
| 1150 . : . : . : . : . : | |
| 4452 TTAGGATCTCATATAGGCCTTTATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTT | |
| | | ::| ||||| ||:|||||||| ||::|||||: | :| ||| -- | |
| 1950 TAATAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGA | |
| 1200 . : . : . : . : . : | |
| 4500 TATGAGCTTCTAAAATATCTTTTAGTCCATGACCAATACCCCAGTT | |
| ----||||:|:||| |:||| ||||| | |:||||||||| || |:|| | |
| 2000 GGAGTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATT | |
| 1250 . : . : . : . : . : | |
| 4546 GGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGGAAAAGAATTGCAATAGCTAAAT | |
| :||:||||||||:||||| ||||| | :|||| ||:|||||||||||||| | |
| 2050 AGTTCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAAT | |
| 1300 . : . : . : . : . : | |
| 4596 GGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAGACCCCCAGTTACTGGATCTAAT | |
| |:||:||:||||||||||| |||||:|:||::: ||| ||||| ||| | |
| 2100 GATGGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAAT | |
| 1350 . : | |
| 4646 CCTCCACGAAAAGT | |
| || ||| |||||| | |
| 2150 CCACCAATAAAAGT | |
| ********************************************************* | |
| Number 4 Local Alignment | |
| Similarity Score : 37.4 | |
| Match Percentage : 64% | |
| Number of Matches : 89 | |
| Number of Mismatches : 45 | |
| Total Length of Gaps : 3 | |
| Begins at (4829, 2339) and Ends at (4962, 2475) | |
| 0 . : . : . : . : . : | |
| 4829 ACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGTAGCCC | |
| ||||| ||| :||| ||:|:||||| |: || |: | || |: ||:|| | |
| 2339 ACATGAACTAAATGACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCC | |
| 50 . : . : . : . : . : | |
| 4879 TGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGCCAATT | |
| || :|||||:|||||:|: |||||| :|||:|| ||||||:| :| || | |
| 2389 TGATAAATGATGATTTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTT | |
| 100 . : . : . : . | |
| 4929 TTGGCGCCGCTTTATGAT AATGAAACCAACCAGC | |
| | ||: :| |||| | |---|||| |||||||| || | |
| 2439 TAGGTTTCCATTTAGGTTGTAAATGTAACCAACCTGC | |
| ********************************************************* | |
| Number 5 Local Alignment | |
| Similarity Score : 28 | |
| Match Percentage : 59% | |
| Number of Matches : 88 | |
| Number of Mismatches : 60 | |
| Total Length of Gaps : 0 | |
| Begins at (5131, 2653) and Ends at (5278, 2800) | |
| 0 . : . : . : . : . : | |
| 5131 CCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTTAGCCACG | |
| |||||:::| ||:||| | ||:|::|::|| : ||:|| : | |||:| | |
| 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG | |
| 50 . : . : . : . : . : | |
| 5181 CTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCTCAGCCAA | |
| ||||| ||||| : |:|||| ||||:|| | |:||: : ||| | |
| 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT | |
| 100 . : . : . : . : . | |
| 5231 AGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTTTTCGA | |
| |:|||:||||| | |:||||||:||||||| :||| |::|||:|| | |
| 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGA | |
| ********************************************************* | |
| Number 6 Local Alignment | |
| Similarity Score : 18 | |
| Match Percentage : 72% | |
| Number of Matches : 29 | |
| Number of Mismatches : 11 | |
| Total Length of Gaps : 0 | |
| Begins at (5929, 5950) and Ends at (5968, 5989) | |
| 0 . : . : . : . : | |
| 5929 TAGTTTTAATAATAAGAATTTTGTTTAATTTAATATAATA | |
| ||| | ||||| ||:|| ||:||||| |||||:|||| | |
| 5950 TAGAGTAAATAAAAAAAAGGTTATTTAAAATAATACAATA | |
| ********************************************************* | |
| Number 7 Local Alignment | |
| Similarity Score : 17.6 | |
| Match Percentage : 60% | |
| Number of Matches : 42 | |
| Number of Mismatches : 16 | |
| Total Length of Gaps : 12 | |
| Begins at (2981, 918) and Ends at (3050, 975) | |
| 0 . : . : . : . : . : | |
| 2981 AATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAA | |
| ||| ||| :|||| | ||: |||||| | |||:| ||:||| |----- | |
| 918 AATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAA | |
| 50 . : . : | |
| 3031 ATTATTGCTAATTGACCAAA | |
| -------|||| |||||||| | |
| 963 CTAAATGACCAAA | |
| ********************************************************* | |
| Number 8 Local Alignment | |
| Similarity Score : 17 | |
| Match Percentage : 71% | |
| Number of Matches : 28 | |
| Number of Mismatches : 11 | |
| Total Length of Gaps : 0 | |
| Begins at (4481, 3583) and Ends at (4519, 3621) | |
| 0 . : . : . : . | |
| 4481 TGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCT | |
| ||| :|||||||| |: ||||| | |||||| |||| | |
| 3583 TGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCT | |
| exit 0 |