| SIM output with parameters: |
| M = 1, I = -1, V = -1 |
| O = 6, E = 0.2 |
| |
| Upper Sequence : tob.38-44 |
| Length : 6000 |
| Lower Sequence : liv.42-48 |
| Length : 6000 |
| |
| ********************************************************* |
| Number 1 Local Alignment |
| Similarity Score : 3265.4 |
| Match Percentage : 76% |
| Number of Matches : 4411 |
| Number of Mismatches : 950 |
| Total Length of Gaps : 378 |
| Begins at (2, 6) and Ends at (5711, 5395) |
| |
| 0 . : . : . : . : . : |
| 2 TATATATCATATATGTGGGTACATATTGTGTATCAAGAACAAAAAAATGC |
| ||||||| ||||| ||-------------------| ||: | | |:|| |
| 6 TATATATAATATAAGT ATAATTTATATACGC |
| |
| 50 . : . : . : . : . : |
| 52 GGATATGGTCGAATGGTAAAATTTCTCTTTGCCAAGGAGAAGATGCGGGT |
| ||:|||:||: ||||||||||||:|||:||||||||||||| |||||||| |
| 37 GGGTATAGTTTAATGGTAAAATTCCTCCTTGCCAAGGAGAATATGCGGGT |
| |
| 100 . : . : . : . : . : |
| 102 TCGATTCCCGCTATCCGCCCAAGATCCAAGATAAAGTAATTTTATTACTA |
| |||||||||||||:|||||------------------------------- |
| 87 TCGATTCCCGCTACCCGCC |
| |
| 150 . : . : . : . : . : |
| 152 TTTATTTATTATTTAATTTCATAAATAGCATTAAATATATCCTTAAATTA |
| -----------------------||| | | ||| || ---|||||| | |
| 106 AATTGAAATAATTAG CTTAAAAAA |
| |
| 200 . : . : . : . : . : |
| 202 AGGATTTGGTATAGTTGGCCGTGATAGTGTAGTGATTCTATCCCTCCCCT |
| ||:|---------------------------------------------- |
| 130 AGAA |
| |
| 250 . : . : . : . : . : |
| 252 ACGTTTTCTTTTTCCTTCCACCCCCAAAAAGCGAAAGGCGGGAATTAATT |
| ----------------------------------------------||| |
| 134 AATA |
| |
| 300 . : . : . : . : . : |
| 302 ACTAGTTAACAGAGTCAACCCTAAAATAGTTTGGCAAAACAAGATGTTGC |
| | ||------------------|||||| ||| ----------| | || |
| 138 AGTA AAAATATTTTTT TTTGGC |
| |
| 350 . : . : . : . : . : |
| 352 GGAGACAGGATTTGAACCCGTGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA |
| ||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||||||||||||| |
| 160 GGAGACAGGATTTGAACCTATGACCTCAAGGTTATGAGCCTTGCGAGCTA |
| |
| 400 . : . : . : . : . : |
| 402 CCAAACTGCTCTACCCCGCGCCGAAGATAAGAACTGAAAACTAATAGATA |
| |||:||||||||||:|||||::: |: ||| :| :||: || | ||| |
| 210 CCAGACTGCTCTACTCCGCGTTATAATTAACGAAAAAAGTATACTCTATA |
| |
| 450 . : . : . : . : . : |
| 452 AACAAGGATTAAATGCGCCCCTCCACCCTATCTGTACAAA TAG |
| || | ||| | ||----------------------||||:-------| | |
| 260 AAAATGGAATTAA ACAAGATATTTTTTG |
| |
| 500 . : . : . : . : . : |
| 495 AATAGCCCATTTATACAGAATGGTAAAGGGGCTTCTATGATCATCGACCA |
| ||||:|||-----------------------| :|| | || | |:| : |
| 288 AATAACCC CGCCTCTTATAAGAGGCGG |
| |
| 550 . : . : . : . : . : |
| 545 TAGAAATAGAAATGAAGCGTTAATCCTTACCAACTTGATCTTGTTGCTCC |
| --------|||| :|| | ||| :||||||||| |||:| |||:|||| |
| 315 GAAAGAAACCCAAAATGTTTACCAACTAGATTTGGTTACTCC |
| |
| 600 . : . : . : . : . : |
| 595 TGGCAACAAACATGCATGAACCATTTCACGAAGTATGTGTCCGGATAGTC |
| |||||:||||||||||||:||||||||||||||| :||||::||||: | |
| 357 AGGCAATAAACATGCATGAGCCATTTCACGAAGTAAATGTCTAGATAAAC |
| |
| 650 . : . : . : . : . : |
| 645 CAAAGTCTCGATAGTTAGCTCTCGGCCTTCCGGTCAAAAAACAACGTCGA |
| ||||:|| |||||:|| |||:| ||:|||||:|||||||||||||| ||| |
| 407 CAAAATCGCGATAATTTGCTTTAGGTCTTCCAGTCAAAAAACAACGACGA |
| |
| 700 . : . : . : . : . : |
| 695 TGAAGGCGTGTAGGTGCACTATTCCGTGGTGGGGATTGTAACTTTCCATA |
| |||||:|| || || |||||||| ||||||:::||||||||:|||:: |: |
| 457 TGAAGACGAGTCGGGGCACTATTACGTGGTAAAGATTGTAATTTTTTTTG |
| |
| 750 . : . : . : . : . : |
| 745 AATTTCCCATTTGTCACTCAACGACGGAACCTTGCTTATTTCTTTCTTTG |
| || ||||||||| |||:::||:||:|:::::|: | ||||:|||:|||: |
| 507 AAATTCCCATTTTTCATCTAATGATGAGGTTTCCGTAATTTTTTTTTTTA |
| |
| 800 . : . : . : . : . : |
| 795 AGGATCGACGAATCGAATGATATTTCTGTTCCAATTTTTGCCTCTTCTTC |
| |:|| : ||| | : | :|||||:| |||:|| |||||:||:||:||: |
| 557 AAGAATTACGTAAAATTTTGTATTTTTTTTCTAAATTTTGTCTTTTTTTT |
| |
| 850 . : . : . : . : . : |
| 845 TCCCTCTGAATCAAACTTTTCCTTGCCATAATGGTTGAATTCCTA |
| ||:||:||||| |:|||:||::|||||||||| :|| |||| ||----- |
| 607 TCTCTTTGAATAAGACTCTTTTTTGCCATAATTATTTAATTAGTAAGATA |
| |
| 900 . : . : . : . : . : |
| 890 TTAGTATCCATGATACAAGTCGAATCCTAGATGTAGAAA |
| -----------| |:| |::|| | | || : ||:| |:|||| |
| 657 TTCTTTTTCAATAAATTTTTATTAAAAAATATTTTGAGTAAAATTGGAAA |
| |
| 950 . : . : . : . : . : |
| 929 TAGAAGAAGGTGGACCCCCTCTCCGTCGAAAGAAATGAGATTATCGCAGA |
| | ||--------------------------------------------- |
| 707 TTTAA |
| |
| 1000 . : . : . : . : . : |
| 979 TACACACATTAAAAATAT TAACCAAATTTGCCCGACGTAGAGGCAA |
| ---------|| ||||||----|||||||||||:|| ||:|||||:|||| |
| 712 TACAAATATAATTTAACCAAATTTACCAGATGTAGAAGCAA |
| |
| 1050 . : . : . : . : . : |
| 1025 TCAAGAAAGCCGCATAAGTGAATATATAACCTACAGAAAAGTGAGCTAAT |
| |:||:||||| ||||||||:||||||||||||||||||||:||||||||| |
| 753 TTAAAAAAGCAGCATAAGTAAATATATAACCTACAGAAAAATGAGCTAAT |
| |
| 1100 . : . : . : . : . : |
| 1075 CCAACCAATCTTGCTTGTACAATGGAAAGGGCCACTGGTTTATCTCTCCA |
| |||||:||||||||||| |||||:|||||:||:||||||||||||:|||| |
| 803 CCAACTAATCTTGCTTGAACAATAGAAAGAGCTACTGGTTTATCTTTCCA |
| |
| 1150 . : . : . : . : . : |
| 1125 GCGAATCAAATTGGCCAAAGGTGTGCGTTCATGAGCCCATGCTAAAGTTT |
| |||||::||||| ||:||||| ||:|||||:|||||||| |||||||||| |
| 853 GCGAACTAAATTCGCTAAAGGAGTACGTTCGTGAGCCCAAGCTAAAGTTT |
| |
| 1200 . : . : . : . : . : |
| 1175 CAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGAAATTAAGAACATAAATCCA |
| |||| |:|||:||||||||||||||||| || ||:|::|||||||||||| |
| 903 CAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCA |
| |
| 1250 . : . : . : . : . : |
| 1225 GTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACATCCATGCCCAAACCGATAA |
| ||||||||||| |:||| ||||||||:||||||||||||||||| ||:|: |
| 953 GTAGCCCAAACTAAATGACCAAATAAAAACATCCATGCCCAAACAGACAG |
| |
| 1300 . : . : . : . : . : |
| 1275 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTGATAAGTTGTGAAGAGTTTA |
| |||||||||||||||||||||||||||:||:|| |:|||||||||:|||| |
| 1003 ACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCATTAATCAATTGTGAAGAATTTA |
| |
| 1350 . : . : . : . : . : |
| 1325 ACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAAATAAGTGGAAGATTCATTA |
| |||||||||||||:||||||||||||||:||||| ||:|||||||||||| |
| 1053 ACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCATTAAATATGTAGAAGATTCATTA |
| |
| 1400 . : . : . : . : . : |
| 1375 AACTGTGAAACGTTACCCTGCCATAATGTGATGTGCTTCCAATGCCAATA |
| ||:|||| :|:|| ||:|||||||||||:||:||:|||||||||||||| |
| 1103 AATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAATGTAATATGTTTCCAATGCCAATA |
| |
| 1450 . : . : . : . : . : |
| 1425 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCAAATAAA |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||| |
| 1153 AAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCTAAATAAA |
| |
| 1500 . : . : . : . : . : |
| 1475 ACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGGCCATCG |
| | ||:||||| || |||||||||||||||||:|||||||| ||:|||||: |
| 1203 AAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTCCAGGACCATCA |
| |
| 1550 . : . : . : . : . : |
| 1525 CACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTTGGAACC |
| || ||||||||||||||:|| ||:|||||||||||||||||:||:|| || |
| 1253 CAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATTAATTTAGATCC |
| |
| 1600 . : . : . : . : . : |
| 1575 ACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAAAC |
| ||||||||||||||||||||:|||||:||:|||||||| |||||||||| |
| 1303 TCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGTAGTATGTAAAC |
| |
| 1650 . : . : . : . : . : |
| 1625 CAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATTGTTAAA |
| | |:|||||||||:||||| ||:||||||||||||||||| ||||||||: |
| 1353 CTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGACCAATTGTTAAG |
| |
| 1700 . : . : . : . : . : |
| 1675 AATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGGCAACCA |
| || |:|||||||||||| |:||| |:|||||:||||||||| ||:||||| |
| 1403 AAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAACCAGGTAACCA |
| |
| 1750 . : . : . : . : . : |
| 1725 GATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATAAAAGTA |
| ||||||:|||| |||||:|||||||||::|:|:||||| |||||||||| |
| 1453 TATGCTTTGACCAGCATTAAATGCTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTA |
| |
| 1800 . : . : . : . : . : |
| 1775 CATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCATTGAGCA |
| ||||:|| ||||||:|||:||||||||||||:|||||||||||||||||| |
| 1503 CATCAAAACCATATAAAGCTTTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCA |
| |
| 1850 . : . : . : . : . : |
| 1825 AATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCGGAGTGCCAAAGGCAAGCAT |
| || |||||||||||:||:|||||:||:|| |||||:|||||:|||||||| |
| 1553 AAAATAGGTTCAATTAAAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCAT |
| |
| 1900 . : . : . : . : . : |
| 1875 GACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGGTATGGAATCCCAGAAAGAGGC |
| :||||||||||||||:||||| ||:|::|||||:|||||:||||| |::| |
| 1603 AACATCATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAAC |
| |
| 1950 . : . : . : . : . : |
| 1925 TGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCTTCTTTATGCTCTAACATTCTT |
| |:||||||||||||||:||||| ||||||||||||||:||||||||||| |
| 1653 TAGCCCAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTA |
| |
| 2000 . : . : . : . : . : |
| 1975 GCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGGATTGTAATCTCTAATGAAAAA |
| ||:|||||||||||||:||||||:||||||||:|||||||||||:||:|| |
| 1703 GCTAATACATTATCTTTATTTTGTTCCGGATTATAATCTCTAATAAAGAA |
| |
| 2050 . : . : . : . : . : |
| 2025 TATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCATGATGAATCCTGCGATATATT |
| |||||||||||||||||||| ||||||||:||:|| || ||:||||||| |
| 1753 AATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATATATT |
| |
| 2100 . : . : . : . : . : |
| 2075 GGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTAGTAAAGTCTTGTGCTATGAAT |
| |:||:||:||||||||||||||||| || |||||:|||||||| | :||: |
| 1803 GATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGAAAC |
| |
| 2150 . : . : . : . : . : |
| 2125 GCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTGAGCTACCAAAGAAGTAATAAC |
| |||||:| |||||||||:|||||:|||||||||||:||:||:|||||||| |
| 1853 GCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAATAAC |
| |
| 2200 . : . : . : . : . : |
| 2175 CCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATTGAAAATGAAGCGAATTATTGA |
| :||||| || ||||:||||||:||||||||||||||||| |||||:||:| |
| 1903 TCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGTTAA |
| |
| 2250 . : . : . : . : . : |
| 2225 TTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGCCCCAATCGTCCCCCGGGGGGA |
| | ||:|||||||||||:|||||||| || ||:|| |||||:|| ||:||| |
| 1953 TAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGAGGA |
| |
| 2300 . : . : . : . : . : |
| 2275 ATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCATACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGT |
| :|||| |: || |:|| ||||| |||||:|| |||||:||:|||||:|| |
| 2003 GTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATTAGT |
| |
| 2350 . : . : . : . : . : |
| 2325 TCTATACATATGACCAGCAACGAGAAAAATAAATGCAATAGCTAAATGGT |
| |||||||||||||||||| |::| |||||:|| |||||||||||||||:| |
| 2053 TCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAATGAT |
| |
| 2400 . : . : . : . : . : |
| 2375 GATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAACTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCC |
| |:||:||||||||||| ||||||||||||||:|||||||||||:||||| |
| 2103 GGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAATCCA |
| |
| 2450 . : . : . : . : . : |
| 2425 CCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCCCGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAA |
| ||:| ||:|||||::||:|| ||||| ||||||||:| || ||||| : |
| 2153 CCAATAAAAGTTAAGATAGCTGTTCCAGCCCCTTGAGATGTTCCAAAAGC |
| |
| 2500 . : . : . : . : . : |
| 2475 ATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAGCATAAAGATTCCATTGACCTGTAA |
| ||||:|||||||||||: :||||||||:|||| ||||||||| ||||:|| |
| 2203 ATGATTACTTGAATCGACATTTTGAGCGTAAATATTCCATTGTCCTGCAA |
| |
| 2550 . : . : . : . : . : |
| 2525 AAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGATGCGGTAATACATCTAAGAAATTATTC |
| |||:|||:||||::|||| |||||:|||||| : :|||:|||||||:| |
| 2253 AAAATGGACCTAGTCCTTCCGGATGTGGTAATTTTGTTAAAAAATTATCC |
| |
| 2600 . : . : . : . : . : |
| 2575 CACCGAACGTACTCCCCTCTGGATGCAGGAATAGCAACATGAACTAAATG |
| ||:| ||||::|| ||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| |
| 2303 CATCTTACGTGTTCGCCTCTTGATTCTGGAATTGCCACATGAACTAAATG |
| |
| 2650 . : . : . : . : . : |
| 2625 CCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCAAAGAGTCCTGACAAATGATGAT |
| |||||||||||:|| ||:|||||:|||||:||||||||:|||||||||| |
| 2353 ACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCCTGATAAATGATGAT |
| |
| 2700 . : . : . : . : . : |
| 2675 TCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCAGGAAACGCTCGGTTTCCATTTC |
| |:|:|||||||||:||||||||:|||||||| || :| ||||||||||| |
| 2403 TTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTTTAGGTTTCCATTTA |
| |
| 2750 . : . : . : . : . : |
| 2725 GGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTAAGGATATGGCAGAAAGAAATAA |
| |||||||::||||||||||||||||||||||| ||:| ||||||| | |
| 2453 GGTTGTAAATGTAACCAACCTGCTATTAAGGAAATAGACGAAAGAATAAC |
| |
| 2800 . : . : . : . : . : |
| 2775 TAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCTTCATTAGTGCGTAAACCGATTG |
| ||:||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||:|||| |
| 2503 TAAAAAAAGAGCTCCATTATAAAGATCTTGATTAGTTCGTAAACCAATTG |
| |
| 2850 . : . : . : . : . : |
| 2825 TATACCACCACTGATAAACACCAGAATAAGCGATATTCACTGGGCCAAGA |
| ||||||||||:||:|| ||||||||||| || ||||| ||||| |||::| |
| 2553 TATACCACCATTGGTATACACCAGAATATGCTATATTAACTGGTCCAGAA |
| |
| 2900 . : . : . : . : . : |
| 2875 GCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGGCCGGTTGACCAAAATGAGGATC |
| || ||:||||||||||||||||| ||:||:|||||||||||||| ||||| |
| 2603 GCTCCTCCTCGAGTAAAAGCTTCAACAGCTGGTTGACCAAAATGCGGATC |
| |
| 2950 . : . : . : . : . : |
| 2925 CCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACATGTAAAGGGTCCTGTACCCACG |
| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||:||| ||||:| |
| 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG |
| |
| 3000 . : . : . : . : . : |
| 2975 ACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCAC |
| :|||||||| ||||||||||| ||:|||||:|:||| ||:||||||||: |
| 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT |
| |
| 3050 . : . : . : . : . : |
| 3025 AGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGTGAGAAGCAAAAATATTCTGATA |
| |:|||||| |||||||||||||||||:|| || |||||||| ||:||||| |
| 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGATA |
| |
| 3100 . : . : . : . : . : |
| 3075 AAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGACTCTCGAAGTCATGTGCGGTAG |
| |||||||||:||||| ||||||||||||||:||:|||||||||||||| | |
| 2803 AAGACGTTCTTCAGTCATATCATCATGACTTTCAAAGTCATGTGCGGTCG |
| |
| 3150 . : . : . : . : . : |
| 3125 CAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGTGGGGTCCTGAGCTAAGCCTTGG |
| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||:|||| ||:|||:||| |
| 2853 CAATACCAAACCAAATACGACGCGTAGTTGGGTCTTGAGATAGGCCCTGG |
| |
| 3200 . : . : . : . : . : |
| 3175 CTAAACCTTGGAAATCGTAATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCT AGC |
| |||||::| ||||||| |:|||||||||||||||||||||||||||-||| |
| 2903 CTAAATTTGGGAAATCTTGATGCCATAATGCTTTTCAAATCCTCCTTAGC |
| |
| 3250 . : . : . : . : . : |
| 3224 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAAGAAGAATGCCCATGTTGTGGC |
| ||||||||||||||||||||||||||||::|||||||||||||||||||| |
| 2953 CATTATCCTACTGCAATAATTCTTGCTAGAAAGAATGCCCATGTTGTGGC |
| |
| 3300 . : . : . : . : . : |
| 3274 AATTCCACCCAGAAGGTAATGGGTTACTCCTACAGCACGTCCTTGTATAA |
| |||||||||:|||||||||||:|:||||||||||||||| ||||||:||| |
| 3003 AATTCCACCTAGAAGGTAATGAGCTACTCCTACAGCACGGCCTTGTGTAA |
| |
| 3350 . : . : . : . : . : |
| 3324 TGCTCAAGGCTCTCGGCTGAGTAGCAGGAGCAACTTTTAATTTATTATGA |
| |:||:||||| | |||||::||||||||||||||||||||||:||:||| |
| 3053 TACTTAAGGCGCGAGGCTGGATAGCAGGAGCAACTTTTAATTTGTTGTGA |
| |
| 3400 . : . : . : . : . : |
| 3374 GCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACTGAA |
| ||||||||:||||||||||||||:||||||||||| ||||| |||||:|| |
| 3103 GCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACTAAA |
| |
| 3450 . : . : . : . : . : |
| 3424 TAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAAAAA |
| ||::||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||::|| |||| |
| 3153 TAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATAAAA |
| |
| 3500 . : . : . : . : . : |
| 3474 GGCCATATGCAGATAATGAAGAACCATAAGACTGAATTACCTGGGATGCC |
| |:||||| |||||||| ||||||||||||||:||||||||:||:|| ||: |
| 3203 GACCATAAGCAGATAAGGAAGAACCATAAGATTGAATTACTTGAGAAGCT |
| |
| 3550 . : . : . : . : . : |
| 3524 TGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCATTAATAGTAATAGAACTTTG |
| |||||||||||:||:||:||:||||| |||||||||||||||| :||||| |
| 3253 TGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAATAGTAATAGCGCTTTG |
| |
| 3600 . : . : . : . : . : |
| 3574 CGCAAAGTTTCCTCCCGTGATATGAGTTACTACCCCTTGATCACTTACAC |
| :|||||:||||| || ||:||||||||||| || ||||| ||:||||:| |
| 3303 TGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACACCTTGCTCGCTTATAG |
| |
| 3650 . : . : . : . : . : |
| 3624 TGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTCCAACTGAAATGGAATATTACTACC |
| |:||||||||||| ||:||||||||||||||:||:||:|| || ||||| |
| 3353 TACCCCAAACATCAGATTGCATTTTCCAACTAAAGTGAAAAATAACTACA |
| |
| 3700 . : . : . : . : . : |
| 3674 GAAATTGCATTGTACATCCAGAATAGTCCTAAGAAGACATGATCCCAGGC |
| ||||| | |||:||||||||:||||: ||||||||:||||||||||| || |
| 3403 GAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTAAGAAAACATGATCCCATGC |
| |
| 3750 . : . : . : . : . : |
| 3724 CGATACTTGACATGTACCCCCTCTTCCAGGTCCATCACAAGGAAAACGAA |
| ||||||||||| || ||:|||||||||||||||||:||||||||||||| |
| 3453 AGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGTCCATCGCAAGGAAAACGAA |
| |
| 3800 . : . : . : . : . : |
| 3774 AACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTCAAACGGGAACTGCGAGCAAATAGA |
| |||||||:|| |||||:||:|||:|||||||:||||| ||||||||||:| |
| 3503 AACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACGAGAACTTCGAGCAAATAAA |
| |
| 3850 . : . : . : . : . : |
| 3824 ACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGTCACATGAATCGTAAATGCATGAAT |
| ||||||||:|| |: ||:|: :| ||:||||||||:|||||||||||||| |
| 3553 ACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACATGAATTGTAAATGCATGAAT |
| |
| 3900 . : . : . : . : . : |
| 3874 GTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTCCTAATGGAATAGGCAACAAAGCCA |
| :||||||||:||:|||||:|| ||||||||:||||| ||:||:||||| | |
| 3603 ATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAACGGAATTGGTAATAAAGCAA |
| |
| 3950 . : . : . : . : . : |
| 3924 CCTTGCCACCCACTGCCACTAAATCACCACCCCCCCAAGTTAAACTGGTA |
| |:||:|:||| |||||:|:|| :|| ||||| ||||| ||||||||:||| |
| 3653 CTTTACTACCAACTGCTATTACGTCTCCACCACCCCATGTTAAACTAGTA |
| |
| 4000 . : . : . : . : . : |
| 3974 CTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGTGCTAAAGCATGGGTGTT |
| ||||||: |||::|||||| || : ::: |||||||||||||| ||||| |
| 3703 CTTGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAAAGTTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTT |
| |
| 4050 . : . : . : . : . : |
| 4024 TTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTATAGCGGTATCTGAAA |
| |||||||||||||||||||||:||||||||||| |||||:|||||||||| |
| 3753 TTGTATCCATTGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAA |
| |
| 4100 . : . : . : . : . : |
| 4074 ACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTATCATTATGAATATAC |
| ||||||||||||||||:||||||||:||||| |||||||||||||||||: |
| 3803 ACATATCTTGAGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATAT |
| |
| 4150 . : . : . : . : . : |
| 4124 AAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCCCAGTTGAGATGGGA |
| || ||||||||:||||| ||||:||| ||:|||:||||:||:||||| || |
| 3853 AATCCAAAACTATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGA |
| |
| 4200 . : . : . : . : . : |
| 4174 TATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAATAGATCGTTGTACC |
| ||| |||||||||||||||| |||:|| ||||||||:|:||:||||||:: |
| 3903 TATTATTGCATCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATT |
| |
| 4250 . : . : . : . : . : |
| 4224 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATGGCTGCATGCGCGGCA |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||:|| |||||:||:||| |
| 3953 GAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCA |
| |
| 4300 . : . : . : . : . : |
| 4274 GCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCCACATGTGATGTGTGAACAATGA |
| ||||||||||| |:||||||||||||||||||:||||||||:|| |: || |
| 4003 GCACCAACTATTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGA |
| |
| 4350 . : . : . : . : . : |
| 4324 CAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGATACGGATAAGGGGGCATGGAAT |
| ||||| |||||:||:||||||||||:|||:||||||||:|||||:| :| |
| 4053 AAGTTGAGTACCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGT |
| |
| 4400 . : . : . : . : . : |
| 4374 ACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAAAGAGCCTAACATAGCTAAGTTA |
| |||||||:||||||||||:|||:||||||||:||:|||||||||||:||| |
| 4103 ACATATGATGAGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTA |
| |
| 4450 . : . : . : . : . : |
| 4424 AGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTGTTAGGATCTCATATAGGCCTTT |
| || | |||||||||||||||||| |||||||::||:||||| ||:||||| |
| 4153 AGTGCTAATTGAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTT |
| |
| 4500 . : . : . : . : . : |
| 4474 ATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCTTTTA |
| |||:|||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
| 4203 ATGACCCTCTCCAGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAA |
| |
| 4550 . : . : . : . : . : |
| 4524 GTCCATGACCAATACCCCAGTTGGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGG |
| : |:||||||:|||||||||||:|| | ||||||:|||||:||||::|:: |
| 4253 AACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAA |
| |
| 4600 . : . : . : . : . : |
| 4574 AAAAGAATTGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAG |
| |||||||:|||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:|||:|: |
| 4303 AAAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAA |
| |
| 4650 . : . : . : . : . : |
| 4624 ACCCCCAGTTACTGGATCTAATCCTCCACGAAAAGTAAGAAAGTCCGCAT |
| ||| |||||||||||||: |:||||||||||||||| |:|||||| | || |
| 4353 ACCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAGAAT |
| |
| 4700 . : . : . : . : . : |
| 4674 ATTTTGACCAATTCAAGGTGAAAAATGGGGTTGCTCCCTCGGCAAAACTG |
| |||:|||||||||:||:||:||||| ||:|||: :||:|: ||||||||: |
| 4403 ATTCTGACCAATTTAAAGTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAACTA |
| |
| 4750 . : . : . : . : . : |
| 4724 GGATAAAGTTGAGCCAAAAGATCTCGATTCAAGATAAATTCATGAGGAAG |
| ||:||||||| |||:|||||||| |||||:||:||||||||||||||||| |
| 4453 GGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGGAAG |
| |
| 4800 . : . : . : . : . : |
| 4774 TGGTATCTCTTTAGGATCTACTCCAGCGTTTAGAAATTGGTTAATCGGTA |
| |||||:||||| ||||| ||||||||:|:||:||::||:||||| |||| |
| 4503 AGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAGGTA |
| |
| 4850 . : . : . : . : . : |
| 4824 AAGATACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGT |
| |||| ||||||||||||||:|| ||||||||:||||| || |: ||||: |
| 4553 AAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCTAAA |
| |
| 4900 . : . : . : . : . : |
| 4874 AGCCCTGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGC |
| || |||||:|||||:|||||:||||||||||| ||||||||||||||||| |
| 4603 AGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCAAGC |
| |
| 4950 . : . : . : . : . : |
| 4924 CAATTTTGGCGCCGCTTTATGATAATGAAACCAACCAGCAAAAAGCATTA |
| :|||||||| || |||||:|||||||||||||| || ||||||||||||| |
| 4653 TAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAATGAAACCATCCTGCAAAAAGCATTA |
| |
| 5000 . : . : . : . : . : |
| 4974 ACGCTGCAAAGACCAATGCCCCAATTGCTGTACAATAGAGTTGTAATTCA |
| |:||||||||:||:||| | |||||||| ||| ||||:|||||||||||| |
| 4703 ATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGTAATTCA |
| |
| 5050 . : . : . : . : . : |
| 5024 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAATCTGAAAAAAACCAGAGGTTATTTG |
| ||||||||||||||||||||||||| :||||||||:||:||||||||||| |
| 4753 CTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGAGGTTATTTG |
| |
| 5100 . : . : . : . : . : |
| 5074 TATTCCTCGGAAACCCCCGCCTACGTCACCATTTAATATTTCTTGGCCCA |
| |||||||:|:||||||||||| ||:|| |||||||| ||||||||:|| | |
| 4803 TATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAATTTCTTGACCAA |
| |
| 5150 . : . : . : . : . : |
| 5124 CTATTGGCCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTT |
| |||| |||||||| ||:||:|||||:|||::|||:||||| ||||||||| |
| 4853 CTATAGGCCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATATGAGTAGGATCACTT |
| |
| 5200 . : . : . : . : . : |
| 5174 AGCCACGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCT |
| |:|||:||||||||||||||||||||||||||:||:||:|||||:||:|| |
| 4903 AACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATGAAAGTACATACCACT |
| |
| 5250 . : . : . : . : . : |
| 5224 CAGCCAAAGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTT |
| :|:||||| |||:||||||| |:||| ||:||||| |||||||| ||:| |
| 4953 TAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAATGAGCACTAAAAACCT |
| |
| 5300 . : . : . : . : . : |
| 5274 TTCGAGAGATCTCCTCCAAATCACTGGTATGGCTATCGAAATCGTGAGCA |
| | |||||:||:||:||:||||||:||||||||||:||:|||||:|||||| |
| 5003 TACGAGAAATTTCTTCTAAATCATTGGTATGGCTGTCAAAATCATGAGCA |
| |
| 5350 . : . : . : . : . : |
| 5324 TCAGCATGTAGGTTCCAGATCCAAGTGGTAGTATCAGGCCCTTTAGCTAT |
| ||||||||||::|||||:|||||||||||||||::||| ||:||||||| |
| 5053 TCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGTACTAGGACCCTTAGCTAG |
| |
| 5400 . : . : . : . : . : |
| 5374 TGTTCTTGAGAAATGACCCGGTCTGGCCCATTCCTCGAACGAAGTTTTTA |
| ||:|||||:||||| || |||:|:|||||||::||:|| ||:||||||| |
| 5103 AGTCCTTGAAAAATGCCCAGGTTTAGCCCATTTTTCAAAAGAGGTTTTTA |
| |
| 5450 . : . : . : . : . : |
| 5424 CGGGATCCCTATCTACCAAAATTTTAACTTCTGGTTCCGGCGAACGAATA |
| |:||||||:| ||:|||| |||:||:||||||||||||||:||||||||| |
| 5153 CAGGATCCTTTTCCACCACAATCTTGACTTCTGGTTCCGGTGAACGAATA |
| |
| 5500 . : . : . : . : . : |
| 5474 ATCATTGAG TCCTCCTCTTTCCGGACAACACATACAAAGAGACCCGCCA |
| :||||:|||-|:|||||||:|:|:|||:| :|||| :||-|:|||::||| |
| 5203 GTCATCGAGGTTCTCCTCTCTTCAGACGAGGCATAGGAA AAACCTACCA |
| |
| 5550 . : . : . : . : . : |
| 5523 ACAGTCAAATAATTAGTGAACCTTAGAGATAGAGAGATATTTCTATAATT |
| |||-----|||||||||:|||:|: |||| | | |||| || |---- |
| 5252 ACA ATAATTAGTAAACTTCTGAGAGATCCATATATAACTTT |
| |
| 5600 . : . : . : . : . : |
| 5573 AGTTCGTTTCTCTTCTATTTTTCTATCTCCCATCTATCTATTTTCTTTAG |
| ---------------|| |:||| ||||-------------------|| |
| 5293 TAGATCTCTTTCTC AG |
| |
| 5650 . : . : . : . : . : |
| 5623 TTATTTACTAGAGCAATTATGATCTGGAAGTCGATCCGGGGCAAGTGTTC |
| || |||:||:|||:||| || ::|||:|::--|| :||||:|| ||| |
| 5309 TTTAAAACTGGAACAACTATTATACAGAAATTA CCTAGGCAGGTCTTC |
| |
| 5700 . : . : . : . |
| 5673 GGATCTATTATGACATAGCCTTGAGGCGCTCAACGGACC |
| ::||:||||||||||:|:::||:|||:|||:||:||||| |
| 5357 AAATTTATTATGACACAATTTTAAGGTGCTTAATGGACC |
| |
| ********************************************************* |
| Number 2 Local Alignment |
| Similarity Score : 278.4 |
| Match Percentage : 55% |
| Number of Matches : 1171 |
| Number of Mismatches : 711 |
| Total Length of Gaps : 218 |
| Begins at (1156, 3100) and Ends at (3152, 5084) |
| |
| 0 . : . : . : . : . : |
| 1156 TGAGCCCATGCTAAAGTTTCAATCAATTCCTGCCAATATCCACGCCAAGA |
| |||||||| :| | :| |||||| |::||:|||||||||||||| | | |
| 3100 TGAGCCCAAACAATGGATTCAATAAGCTCTTGCCAATATCCACGACCACT |
| |
| 50 . : . : . : . : . : |
| 1206 AATTAAGAACATAAATCCAGTAGCCCAAACAAGATGTCCAAATAAGAACA |
| || ||||||||| || |:|: |||||||||||::|| || |||:||:| |
| 3150 AAATAAGAACATTAAACTAAAAGCCCAAACAAAGTGAGCACCTAAAAATA |
| |
| 100 . : . : . : . : . : |
| 1256 TCCATGCCCAAACCGATAAACTATTCATACCAAAAGGATTATATCCGTTG |
| : | :||:| |||||: ------------|||:|::||| | : |
| 3200 AAAGACCATAAGCAGATAAGG AAGAACCATAAGATTGA |
| |
| 150 . : . : . : . : . : |
| 1306 ATAAGTTGTGAAGAGTTTAACCATAAATAATCCCTTAACCAGCCCATCAA |
| || | ||| |||| | |: ||||||| |:|| | |:|||:|| | | |
| 3238 ATTACTTGAGAAGCTTGTGCCCATAAAAAGTCACGAAGCCAACCATTAAT |
| |
| 200 . : . : . : . : . : |
| 1356 ATAA GTGGAAGATT CATTAAACTGTGAAACGTTAC |
| | |----------||| ||:|||-----|: ||| || | ||: :|| |
| 3288 AGTAATAGCGCTTTGTGCAAAATTTCCACCGGTAATATGAGTTACAACAC |
| |
| 250 . : . : . : . : . : |
| 1391 CCTGC CATAATGTGATGTGCTTCCAATG |
| |:|||----------------------|| | ||:: |----||||||: |
| 3338 CTTGCTCGCTTATAGTACCCCAAACATCAGATTGCATT TTCCAACT |
| |
| 300 . : . : . : . : . : |
| 1419 CCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAACTGCCA |
| |:|:||||:||||: ||||| ||| |||||||||| | |:| |
| 3384 AAAGTGAAAAATAACTACAGAAATAGAATTATACATCCAAAATAAACCTA |
| |
| 350 . : . : . : . : . : |
| 1469 AATAAAACGCGTCCCATGCCGAAATATCACAAGTACCGCCTCGTCCTGGG |
| |: ||| :|||||||| || |: | |||||| || |||| ||| || |
| 3434 AGAAAACATGATCCCATGCAGATACTTGACAAGTTCCTCCTCTTCCAGGT |
| |
| 400 . : . : . : . : . : |
| 1519 CCATCGCACGGAAAACTATAACCGAAATCCTTTTTATCTGGCATTAACTT |
| |||||||| ||||||| | ||||:|:||: :|||:|||||:||:|| : |
| 3484 CCATCGCAAGGAAAACGAAAACCAAGATTAGCTTTGTCTGGTATCAAACG |
| |
| 450 . : . : . : . : . : |
| 1569 GGAACCACGTGCATCTAAAGCACCTTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTAT |
| :||||: || ||| ||||:||||||||| |||:||:|| ::||||::|| |
| 3534 AGAACTTCGAGCAAATAAAACACCTTTTAATAAAATTAAAACAGTTACAT |
| |
| 500 . : . : . : . : . : |
| 1619 GTAAACCAAGAGCAATAGCATGATGAACCAAAAAGTCTCCAGGACCTATT |
| | | :||: ||| |::|||||| ||:|||||:||| | | |||| : |
| 3584 GAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCTGCTGTTCCTAAC |
| |
| 550 . : . : . : . : . : |
| 1669 GTTAAAAATAATGAATTACTATTTTCATTAACAGCATTTAACCAACCCGG |
| | | ::||||:|| :| : || ::|::||| || |||--|: |:| : |
| 3634 GGAATTGGTAATAAAGCAACTTTACTACCAACTGCTATTA CGTCTCCA |
| |
| 600 . : . : . : . : . : |
| 1719 CAACCAGATGCTTCGACCCGCATTGAATGCTGGACCACTCGTTGAAGATA |
| | ||| |||-|| :||: |:|:|---||||::| ||:| | | || | |
| 3682 CCACCCCATG TTAAACTAGTACT TGCTAAAGCATTAGGAGCAGTAA |
| |
| 650 . : . : . : . : . : |
| 1769 AAAGTACATCGAACCCATATGAAGTTTTACCATGAGCGGATTGTATCCAT |
| |:---------------| ||: |:| | |||| |:| |||||||||| |
| 3728 AG TTTGGTGCTAAAGCATGTGTGTTTTGTATCCAT |
| |
| 700 . : . : . : . : . : |
| 1819 TGAGCAAATATAGGTTCAATCAAGATTTGCTTCTCCG |
| |||||||| |:||||| | : ::|| | ||:|------------- |
| 3763 TGAGCAAAAACAGGTTGTAATTGAATAGCAGTATCTGAAAACATATCTTG |
| |
| 750 . : . : . : . : . : |
| 1856 GAGTGCCAAAGGCAAGCATGACATCATTATGAACATAAAGTCCCAGGG |
| --|| || ||:||| ||| ::|||||||||||:||| |:||| |:: |
| 3813 AGGACGTCCTAAAGCACTCATCGTATCATTATGAATATATAATCCAAAAC |
| |
| 800 . : . : . : . : . : |
| 1904 TATGGAATCCCAGAAAGAGGCTGGCCCAACTTAAATGAGATATGATAGCT |
| ||||:|||||:|:||||| || :|||||:| |:||| ||||| || || |
| 3863 TATGAAATCCTAAAAAGATGCATACCCAATTAAGATGTGATATTATTGCA |
| |
| 850 . : . : . : . : . : |
| 1954 TCTTTATGCTCTAACATTCTTGCCAATACATTATCTTCATTTTGCTCCGG |
| || : |||:: |: |:|| |:||:| |||:|: | | ::|| |
| 3913 TCACGATGTCGAAGAACTCGATCTAACAAATTGTTGTATTGAGTAGTTGG |
| |
| 900 . : . : . : . : . : |
| 2004 ATTGTAATCTCTAATGAAAAATATAGCTCCATGAGCAAAAGCTCCTGTCA |
| ||::|||||||| |: | ||| ||||| |||| |||: ||| || :::| |
| 3963 ATCATAATCTCTTACCATAAAAATAGCAGCATGTGCAGCAGCACCAACTA |
| |
| 950 . : . : . : . : . : |
| 2054 TGATGAATCCTGCGATATATTGGTGGTGGGTATATAATGCAGCTTGAGTA |
| | | :||||| |:|| :|: :||:|| ||| | |: | |: ||||||| |
| 4013 TTAAAAATCCACCAATCCACATATGATGTGTAAAAAGAGAAAGTTGAGTA |
| |
| 1000 . : . : . : . : . : |
| 2104 GTAAAGTCTTGTGCTATGAATGCATAAGCAGGTAAAGAGTACATGTGTTG |
| :: |:|| |||| : ||| ||||| |||:| || ||||||:|| || |
| 4063 CCGTAATCAGTAGCTAAATATGGATAAGGAGGCATAGCGTACATATGATG |
| |
| 1050 . : . : . : . : . : |
| 2154 AGCTACCAAAGAAGTAATAACCCCTAAAGAAGCTAGAGCAAGGCCTAATT |
| |||||| | |: ||| | |: ||:|| : |||||:| :||| |||||| |
| 4113 AGCTACAATAATAGTTAAAGAACCCAACATAGCTAAATTAAGTGCTAATT |
| |
| 1100 . : . : . : . : . : |
| 2204 GAAAATGAAGCGAATTATTGATTGTGTCATAAAGACCCTTATGTCCACGC |
| ||: ||| ::||| | | | :| |||||||||||:||||| || : : |
| 4163 GAGCATGCCATGAAGTTGTTAAAATTTCATAAAGACCTTTATGACCCTCT |
| |
| 1150 . : . : . : . : . : |
| 2254 CCC AATCGTCCCCCGGGGGGAATATGTGCATCTAAAAGGTCTTTCAT |
| || ---||| | ||::---------|||| || ||||||| ||||| | |
| 4213 CCAGTAAATGGACCTT TATGAGCTTCTAAAATTTCTTTAAA |
| |
| 1200 . : . : . : . : . : |
| 2301 ACTGTGCCCAATCCCGAAATTGGTTCTATACATATGACCAGCAACGAGAA |
| |||:|| ||:|| || |:||:|| | |||||||||||| || || |:|| |
| 4254 ACTATGACCGATACCCCAGTTAGTACGATACATATGACCTGCTACTAAAA |
| |
| 1250 . : . : . : . : . : |
| 2351 AAATAAATGCAATAGCTAAATGGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCATAAA |
| ||| || |||||||||||||||:|||||:|| :|||||||:|:||||||| |
| 4304 AAAGAACTGCAATAGCTAAATGATGATGAGCTGTATCAGTTAACCATAAA |
| |
| 1300 . : . : . : . : . : |
| 2401 CTTTGCGTTTGTGGATGGAATCCCCCGAGAAGAGTTAGAATGGCAGTTCC |
| |: : ||| ||||| :|:|||:||: |||:|||||:|| | |||---- |
| 4354 CCGCCAGTTACTGGATTAAGTCCTCCACGAAAAGTTAAAAAGTCAG |
| |
| 1350 . : . : . : . : . : |
| 2451 CGCCCCTTGGGCGGTACCAAATAAATGACTACTTGAATCGGGGTTTTGAG |
| ------------------|| ||||:| || || ------------ |
| 4400 AATATTCTGACCAATTTAAA |
| |
| 1400 . : . : . : . : . : |
| 2501 CATAAAGATTCCATTGACCTGTAAAAAGTGGGCCTAACCCTTGGGGA |
| --------------------|||||||: ||: :|||||||| | |--- |
| 4420 GTAAAAAAAGGAGTTAACCCTTTTGCAAAA |
| |
| 1450 . : . : . : . : . : |
| 2548 TGCGGTAA TACATCTAAGAAATTA |
| -|: |||||--| || ||||:|:||:|----------------------- |
| 4450 CTAGGGTAAAGTTCAGCTAAAAGATCACGATTTAAAATAAATTCATGAGG |
| |
| 1500 . : . : . : . : . : |
| 2572 TTCCACCGAACGTACTCC CCTCTGGATGC AG |
| ---------|||: ::|:|: |||||--| |||::| ||--------|| |
| 4500 AAGAGGTATTTCTTTTGGATCAACTCCAGCATCTAAAAGCTGATTAATAG |
| |
| 1550 . : . : . : . : . : |
| 2603 GAATAGCAACATGAACTAAATGCCCTGTCCAAGCCAAGGAACTTACGCCA |
| | | || |||||| ||| :|||:|| |:||||| |::||||:|| ||| |
| 4550 GTAAAGAAACATGTACTTGATGTCCAGCCCAAGAAAGAGAACCTAAGCCT |
| |
| 1600 . : . : . : . : . : |
| 2653 AAGAGTCCTGACAAATGATGATTCAGACGAGATTCGGCATTTTTGAACCA |
| ||:|| |||| :|||||||||||:|| ||||||::|||:|| :||||| |
| 4600 AAAAGACCTGCTAAATGATGATTTAGCATAGATTCAACATCTTGAAACCA |
| |
| 1650 . : . : . : . : . : |
| 2703 GGAAACGCTCGGTTTCCATTTCGGTTGTAGGTGTAACCAACCTGCTATTA |
| :| | :|:|| : ||| | |: ---|| ||||| ||||| | | |
| 4650 AGCTAATTTTGGAGCAGCTTTGTGATAA TGAAACCATCCTGCAAAAA |
| |
| 1700 . : . : . : . : . : |
| 2753 AGGATATGGCAGAAAGAAATAATAGAAAAAGAGCACCAGTATAAAGATCT |
| : : || || | ||:|| |||| | || ||| :|| |||||| | | |
| 4697 GCATTAATGCTGCAAAAACTAATCCACCAATTGCAGTAGAATAAAGTTGT |
| |
| 1750 . : . : . : . : . : |
| 2803 TCATTAGTGCGTAAACCGATTGTATACCACCACTGATAAACACCAGAATA |
| |:| |: || ||:: ||: ::||| ::||| ||| :||:||--- |
| 4747 AATTCACTAGTTATTCCAGATGCTCGCCAAAGTTGAAAAAAGCCGGA |
| |
| 1800 . : . : . : . : . : |
| 2853 AGCGATATTCACTGGGCCAAGAGCACCCCCTCGAGTAAAAGCTTCCACGG |
| ---|:| |: |: || ||: |||||| | |::| | |::| :: |
| 4794 GGTTATTTGTATTCCTTGAAAACCCCCGCCAACATCCCCATTTAAAA |
| |
| 1850 . : . : . : . : . : |
| 2903 CCGGTTGACCAAAATGAGGATCCCAAATTGCATGAGCAATAGGTCTTACA |
| :: |||||||| |||---|||||: :| |||||| |:||::| |:| |
| 4841 TTTCTTGACCAACTATAGG CCAAACAACTTGAGCACTGGGCTTAATA |
| |
| 1900 . : . : . : . : . : |
| 2953 TGTAAAGGGTCCTGTACCCACGACTCAAAATTTCCTTGCCAAGCTACATG |
| || : |||:|| : || |||:| :||| |||| : |:||| |||| |
| 4888 TGAGTAGGATCACTTAACCATGCTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCATG |
| |
| 1950 . : . : . : . : . : |
| 3003 AAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAAATTATTGCTAATTGACCAAAGT |
| ||| : | ||: : ||| | |||||| || |||||||| |||||:| |
| 4938 AAAGTACATACCACTTAACCAAATAAAAATGATGGCTAATTGCCCAAAAT |
| |
| 2000 . : . : . : . : . : |
| 3053 GAGAAGCAAAAATATTCTGATAAAGACGTTCCTCAGTAATATCATCATGA |
| ||| | :|||||: || :|| ||| ---|||:|| : | :||:: :|||: |
| 4988 GAGCACTAAAAACCTTACGAGAAAT TTCTTCTAAATCATTGGTATGG |
| |
| 2050 . : . : . : . : . : |
| 3103 CTCTCGAAGTCATGTGCGGTAGCAATACCAAACCAAATACGACGAGTAGT |
| || ||:||:||||| ||: :|||| | |||||| |:| :||||| |
| 5035 CTGTCAAAATCATGAGCATCAGCATGTAAATTCCAAATCCAAGTGGTAGT |
| |
| ********************************************************* |
| Number 3 Local Alignment |
| Similarity Score : 255.2 |
| Match Percentage : 57% |
| Number of Matches : 788 |
| Number of Mismatches : 417 |
| Total Length of Gaps : 159 |
| Begins at (3371, 884) and Ends at (4659, 2163) |
| |
| 0 . : . : . : . : . : |
| 3371 TGAGCCCAAACGATGGATTCAATAAGTTCTTGCCAATAACCACGTCCACT |
| |||||||||:| | :| ||||||||||||||||||||| |||||:| |
| 884 TGAGCCCAAGCTAAAGTTTCAATAAGTTCTTGCCAATATCCACGCCACGA |
| |
| 50 . : . : . : . : . : |
| 3421 GAATAGAAACATTAAACTAAAAGCCCAGACAAAATGAGCACCTAGGAAAA |
| | :|||||||| || |:|: ||||||:|| |||||| || ||----|| |
| 934 TATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAACTAAATGACCAAATA AA |
| |
| 100 . : . : . : . : . : |
| 3471 AAAGGCCATATGCAGATAATGA AGAACCATAAGA |
| || : ||||:: ||:|:|: |----------------||:|::||| |
| 980 AACATCCATGCCCAAACAGACAGACTATTCATACCAAAAGGATTATATCC |
| |
| 150 . : . : . : . : . : |
| 3505 CTGAATTACCTGGGATGCCTGTGCCCATAAGAAATCGCGGAGCCACCCAT |
| | |||:| :|| || | | |: ||||||: |||| | |:||| || |
| 1030 ATTAATCAATTGTGAAGAATTTAACCATAAATAATCTCTTAACCAGCCCA |
| |
| 200 . : . : . : . : . : |
| 3555 TAATAGTAATAGAACTTTGCGCAAAGTTTCCTCC CGTGATATGAG |
| | | | :||||| || :||| | | || |-----| || :||:| |
| 1080 TTAAATATGTAGAAGATTCATTAAATTGTGCTGCATTTCCTTGCCATAAT |
| |
| 250 . : . : . : . : . : |
| 3600 TTACTACCCCTTGATCACTTACACTGCCCCAAACATCTGACTGCATTTTC |
| || ||: --------------------------------------|||| |
| 1130 GTAATATG TTTC |
| |
| 300 . : . : . : . : . : |
| 3650 CAACTGAAATGGAATATTACTACCGAAATTGCATTGTACATCCAGAATAG |
| |||: |||::|| :| ||: : ||| |:||| |||||||:|| | |
| 1142 CAATGCCAATAAAAAGTAACCCATCCAATAGTATTTAACATCCAAAAAAC |
| |
| 350 . : . : . : . : . : |
| 3700 TCCTAAGAAGACATGATCCCAGGCCGATACTTGACATGTACCCCCTCTTC |
| | ||||: |:| | ||||||:|| || |: | ||| ||||| |||| || |
| 1192 TGCTAAATAAAAAGCATCCCAAGCAGAAATATCACAAGTACCACCTCGTC |
| |
| 400 . : . : . : . : . : |
| 3750 CAGGTCCATCACAAGGAAAACGAAAACCAAGGTTTGCTTTATCCGGTGTC |
| |||| |||||||||||||||| | ||||||: |:| :||||||:||::|: |
| 1242 CAGGACCATCACAAGGAAAACTATAACCAAATTCTTTTTTATCTGGCATT |
| |
| 450 . : . : . : . : . : |
| 3800 AAACGGGAACTGCGAGCAAATAGAACACCTTTCAAGAGTATCAGTGCCGT |
| || : :|| |: || ||| ||:|:||||||||| |: ||:|:||: || |
| 1292 AATTTAGATCCTCGTGCATCTAAAGCACCTTTCACTAAAATTAATGTAGT |
| |
| 500 . : . : . : . : . : |
| 3850 CACATGAATCGTAAATGCATGAATGTGATGTACCAAGAAATCCGCGGTTC |
| ::||| | : || ||| |::|||||||||:||:||:||: |:| | |
| 1342 AGTATGTAAACCTAAAGCAATAGCGTGATGTACTAAAAAGTCTCCAGGAC |
| |
| 550 . : . : . : . : . : |
| 3900 CTAATG GAATAG GCAACAAAGCCA |
| | | ||----||| ||----------------------||| | || | | |
| 1392 CAATTGTTAAGAAAAGTGAATTACTATTATTATTTATAGCATCTAACCAA |
| |
| 600 . : . : . : . : . : |
| 3924 CCTTGCCACCCACTGC CACTAAATCACCACCCCCCCAAGTT |
| || |: ||| |||---------||:||||| ---------------- |
| 1442 CCAGGTAACCATATGCTTTGACCAGCATTAAATG |
| |
| 650 . : . : . : . : . : |
| 3965 AAACTGG TACTTGCTGTTGCACCAGGAGCCGTTGCACCAGGT GCT |
| ---||||--||:|||:|| || |:| :| : : |||| :|---||| |
| 1476 CTGGATTATTTGTTGATGATAAAAGTACATCAAAACCATATAAAGCT |
| |
| 700 . : . : . : . : . : |
| 4010 AAAGCATGGGTGTTTTGTATCCATTGAGCAAAAACGGGTTGTAATTGTAT |
| | ||||:|:: ||||||||||||||||||||::|||| | | ---- |
| 1523 TTACCATGAGCAGATTGTATCCATTGAGCAAAAATAGGTTCAATTA |
| |
| 750 . : . : . : . : . : |
| 4060 AGCGGTATCTGAAAACATATCTTGAGGACGCCCTAAAGCGCTCATGGTAT |
| -----------||| : |:|| |||| || |||||: |||:::|| |
| 1569 AAATTTGTTTTTCAGGAGTACCAAAAGCAAGCATAACAT |
| |
| 800 . : . : . : . : . : |
| 4110 CATTATGAATATACAAACCAAAACTGTGAAAGCCTAGAAATATACATGCC |
| |||||||||::|| |:||| ||| |:||||| |||||||||| || ||| |
| 1608 CATTATGAACGTAAAGACCTAAAGTATGAAATCCTAGAAATAAACTAGCC |
| |
| 850 . : . : . : . : . : |
| 4160 CAGTTGAGATGGGATATGATTGCATCACGATGTCTAAGGACACGATCTAA |
| ||::| |:||||||||| || || || : ||||:: |: |: | | |||| |
| 1658 CAACTTAAATGGGATATTATAGCTTCTTTATGTTCTAACATTCTAGCTAA |
| |
| 900 . : . : . : . : . : |
| 4210 TAGATCGT TGTACCGAGTAGTTGGATCATAATCTCTTACCAT |
| || ||::|--------||| |||--------|||:||||||||| |: | |
| 1708 TACATTATCTTTATTTTGTTCCG GATTATAATCTCTAATAAA |
| |
| 950 . : . : . : . : . : |
| 4252 AAAAATGGCTGCATGCGCGGCAGCACCAACTATGAGAAATCCACCAATCC |
| :|||||:||| |||| ||:: |||||| :::||:| ||| ||| |||| : |
| 1750 GAAAATAGCTCCATGAGCAAAAGCACCTGTCATAATAAAACCAGCAATAT |
| |
| 1000 . : . : . : . : . : |
| 4302 ACATGTGATGTGTGAACAATGACAGTTGTGTACCATAGTCAGTAGCTAGA |
| |: :||||| ||: |:|||| : |||:|| :| |:|| || ||| |
| 1800 ATTGATGATGAGTATATAATGCAGCTTGCGTTGTAAAATCTTGTGCAAGA |
| |
| 1050 . : . : . : . : . : |
| 4352 TACGGATAAGGGGGCATGGAATACATATGGTGAGCTACAACAATGGTTAA |
| ||| |||:||:||:| :||||||||||| |||||||| | :: ||| | |
| 1850 AACGCATAGGGAGGTAAAGAATACATATGTTGAGCTACTAAGGAGGTAAT |
| |
| 1100 . : . : . : . : . : |
| 4402 AGAGCCTAACATAGCTAAGTTAAGAGATAATTGAGCATGCCATGACGTTG |
| |: ||||||: |||||: :|||| |||||||: ||| : || | |
| 1900 AACTCCTAACGATGCTAAAGCAAGACCTAATTGAAAATGAAGAGAATTGT |
| |
| 1150 . : . : . : . : . : |
| 4452 TTAGGATCTCATATAGGCCTTTATGGCCCTGACCTGTAAATGGACCTT |
| | | ::| ||||| ||:|||||||| ||::|||||: | :| ||| -- |
| 1950 TAATAGTATCATAAAGACCTTTATGTCCTCGACCTAAACGTCCTCCTGGA |
| |
| 1200 . : . : . : . : . : |
| 4500 TATGAGCTTCTAAAATATCTTTTAGTCCATGACCAATACCCCAGTT |
| ----||||:|:||| |:||| ||||| | |:||||||||| || |:|| |
| 2000 GGAGTATGGGTTTCAAGAATTTCTTTGATACTATGACCAATTCCAAAATT |
| |
| 1250 . : . : . : . : . : |
| 4546 GGTCCTATACATGTGACCCGCTATCAGGAAAAGAATTGCAATAGCTAAAT |
| :||:||||||||:||||| ||||| | :|||| ||:|||||||||||||| |
| 2050 AGTTCTATACATATGACCAGCTATAATAAAAACAACTGCAATAGCTAAAT |
| |
| 1300 . : . : . : . : . : |
| 4596 GGTGATGGGCAATATCAGTCAGCCACAGACCCCCAGTTACTGGATCTAAT |
| |:||:||:||||||||||| |||||:|:||::: ||| ||||| ||| |
| 2100 GATGGTGAGCAATATCAGTAAGCCATAAACTTTGTGTTTGTGGATGAAAT |
| |
| 1350 . : |
| 4646 CCTCCACGAAAAGT |
| || ||| |||||| |
| 2150 CCACCAATAAAAGT |
| |
| ********************************************************* |
| Number 4 Local Alignment |
| Similarity Score : 37.4 |
| Match Percentage : 64% |
| Number of Matches : 89 |
| Number of Mismatches : 45 |
| Total Length of Gaps : 3 |
| Begins at (4829, 2339) and Ends at (4962, 2475) |
| |
| 0 . : . : . : . : . : |
| 4829 ACATGTACTTGATGCCCCGCCCAAGAGAGAGACCCAAGTCCTAGTAGCCC |
| ||||| ||| :||| ||:|:||||| |: || |: | || |: ||:|| |
| 2339 ACATGAACTAAATGACCTGTCCAAGCTAATGAGCTTACACCAAAAAGTCC |
| |
| 50 . : . : . : . : . : |
| 4879 TGCCAAATGGTGATTCAGCATAGATTCTACATCTTGAAACCAAGCCAATT |
| || :|||||:|||||:|: |||||| :|||:|| ||||||:| :| || |
| 2389 TGATAAATGATGATTTAAACGAGATTCAGCATTTTTAAACCAGGATACTT |
| |
| 100 . : . : . : . |
| 4929 TTGGCGCCGCTTTATGAT AATGAAACCAACCAGC |
| | ||: :| |||| | |---|||| |||||||| || |
| 2439 TAGGTTTCCATTTAGGTTGTAAATGTAACCAACCTGC |
| |
| ********************************************************* |
| Number 5 Local Alignment |
| Similarity Score : 28 |
| Match Percentage : 59% |
| Number of Matches : 88 |
| Number of Mismatches : 60 |
| Total Length of Gaps : 0 |
| Begins at (5131, 2653) and Ends at (5278, 2800) |
| |
| 0 . : . : . : . : . : |
| 5131 CCAAACCACCTGGGCACTAGGCCCAATGTGAGTTGGATCACTTAGCCACG |
| |||||:::| ||:||| | ||:|::|::|| : ||:|| : | |||:| |
| 2653 CCAAATTGCATGAGCAATTGGTCTGACATGTAAAGGGTCTTGTCCCCATG |
| |
| 50 . : . : . : . : . : |
| 5181 CTTCATAATTAGAAAAACGAGCACCGTGGAAATACATGCCGCTCAGCCAA |
| ||||| ||||| : |:|||| ||||:|| | |:||: : ||| |
| 2703 CTTCAAAATTACCTTGCCAAGCAACGTGAAATAAATTACCAGAAGTCCAT |
| |
| 100 . : . : . : . : . |
| 5231 AGAAAGATGATGGAGAGTTGACCGAAATGTGCACTAAATACTTTTCGA |
| |:|||:||||| | |:||||||:||||||| :||| |::|||:|| |
| 2753 AAAAAAATGATTGCTAATTGACCAAAATGTGACGCAAAAATCTTTTGA |
| |
| ********************************************************* |
| Number 6 Local Alignment |
| Similarity Score : 18 |
| Match Percentage : 72% |
| Number of Matches : 29 |
| Number of Mismatches : 11 |
| Total Length of Gaps : 0 |
| Begins at (5929, 5950) and Ends at (5968, 5989) |
| |
| 0 . : . : . : . : |
| 5929 TAGTTTTAATAATAAGAATTTTGTTTAATTTAATATAATA |
| ||| | ||||| ||:|| ||:||||| |||||:|||| |
| 5950 TAGAGTAAATAAAAAAAAGGTTATTTAAAATAATACAATA |
| |
| ********************************************************* |
| Number 7 Local Alignment |
| Similarity Score : 17.6 |
| Match Percentage : 60% |
| Number of Matches : 42 |
| Number of Mismatches : 16 |
| Total Length of Gaps : 12 |
| Begins at (2981, 918) and Ends at (3050, 975) |
| |
| 0 . : . : . : . : . : |
| 2981 AATTTCCTTGCCAAGCTACATGAAACAGATTTCCGGAAGTCCACAGAAAA |
| ||| ||| :|||| | ||: |||||| | |||:| ||:||| |----- |
| 918 AATATCCACGCCACGATATCAGAAACATAAATCCAGTAGCCCAAA |
| |
| 50 . : . : |
| 3031 ATTATTGCTAATTGACCAAA |
| -------|||| |||||||| |
| 963 CTAAATGACCAAA |
| |
| ********************************************************* |
| Number 8 Local Alignment |
| Similarity Score : 17 |
| Match Percentage : 71% |
| Number of Matches : 28 |
| Number of Mismatches : 11 |
| Total Length of Gaps : 0 |
| Begins at (4481, 3583) and Ends at (4519, 3621) |
| |
| 0 . : . : . : . |
| 4481 TGACCTGTAAATGGACCTTTATGAGCTTCTAAAATATCT |
| ||| :|||||||| |: ||||| | |||||| |||| |
| 3583 TGAATTGTAAATGCATGAATATGATGTACTAAAAAATCT |
| exit 0 |
